[发明专利]一种与香猪产仔数相关的FSTL5基因中SV477标记及其检测方法在审
| 申请号： | 201910819710.X | 申请日： | 2019-08-31 |
| 公开（公告）号： | CN110452996A | 公开（公告）日： | 2019-11-15 |
| 发明（设计）人： | 冉雪琴;王嘉福;牛熙;卢圣菲 | 申请（专利权）人： | 贵州大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 52100 贵阳中新专利商标事务所 | 代理人： | 吴无惧<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
| 地址： | 550025贵州省贵*** | 国省代码： | 贵州;52 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 产仔数 香猪 关联分析 结构变异 基因组 内含子 性状 叶酸 繁殖 参考 基因 检测 | ||
1.一种与香猪产仔数相关的FSTL5基因中结构变异SV477分子标记，其特征在于：所述的SV477结构变异为猪参考基因组缺失477bp，位于类叶酸5基因内含子2中，SV477结构变异片段为chr8：50916421-50916897。
2.根据权利要求1所述的一种与香猪产仔数相关的结构变异SV477分子标记，其特征在于：所述的SV477分子标记的引物为：正向引物FSTL5-F：TGGCCATCTTCCTTATCTTATGAG，反向引物FSTL5-R：AACACCTTCTGCAGCTTAATAACAA。
3.如权利要求1或2所述的SV477分子标记在鉴定香猪产仔数中的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：(1)提取香猪的血液/组织基因组DNA；(2)以上述香猪基因组DNA为模板，利用所述引物FSTL5-F和FSTL5-R，进行PCR扩增，检测猪基因组SV477的基因型；(3)根据上述检测结果，如果目的片断纯合不缺失，则待测猪有产仔数较高的可能性；如果此片断缺失，则待测个体有低产仔数倾向。
4.根据权利要求3所述的SV477分子标记在鉴定香猪产仔数中的检测方法，其特征在于：步骤(2)中进行PCR所用的扩增体系，10μL。
10×PCR Mix 5.00μL FSTL5-F(0.10μg/μL) 0.10μL FSTL5-R(0.10μg/μL) 0.10μL DNA 1.00μL 2O]]> 3.80μL
PCR反应条件为：
5.如权利要求1或2所述的SV477分子标记在香猪产仔数相关的分子标记辅助选择方法中的应用，其特征在于：包括以下步骤：(1)采用PCR技术检测该SV477位点在香猪群体中的基因型分布情况(2)应用SPSS v20.0中的卡方检验进行双侧检验，分析高产仔数香猪群体与低产仔猪香猪群体SV477的基因型分布频率。(3)根据结构变异SV477进行有高产仔数优势母猪的选育。
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