[发明专利]一种与香猪产仔数相关的NELFA基因中SV40分子标记及应用在审
| 申请号： | 201910819725.6 | 申请日： | 2019-08-31 |
| 公开（公告）号： | CN110373483A | 公开（公告）日： | 2019-10-25 |
| 发明（设计）人： | 冉雪琴;牛熙;王嘉福;卢圣菲 | 申请（专利权）人： | 贵州大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 贵阳中新专利商标事务所 52100 | 代理人： | 吴无惧 |
| 地址： | 550025 贵州省贵*** | 国省代码： | 贵州;52 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 产仔数 香猪 分子标记 基因 关联分析 结构变异 基因组 内含子 性状 应用 繁殖 参考 分析 发现 | ||
1.一种与香猪产仔数相关的NELFA基因中SV40分子标记，其特征在于：所述的SV40分子标记是指猪基因组中，候选区域chr8：1111424-1111463的结构变异，该区域缺失40bp，或不缺失。
2.根据权利要求1所述的一种与香猪产仔数相关的SV40分子标记，其特征在于：所述的SV40分子标记的引物对为正向引物NELFA-F：GCCTTGACCTACTGCATCCATG，反向引物NELFA-R：CAGAACCACGCATACAGTCAGATC。
3.如权利要求1或2所述的SV40分子标记在鉴定香猪产仔数中的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：(1)提取香猪的血液/组织基因组DNA；(2)以上述提取的DNA基因组为模板，利用2所述引物NELFA-F和NELFA-R，进行PCR扩增，检测香猪基因组SV40的基因型；(3)根据上述检测结果，如果目的片断纯合不缺，则待测香猪有产仔数较高的可能性；如果此片段缺失，则待测香猪个体有低产仔数倾向。
4.根据权利要求3所述的SV40分子标记在鉴定香猪产仔数中的检测方法，其特征在于：步骤(2)中进行PCR所使用的扩增体系为20μL，分别为：2×Taq PCR Master Mix 10μL，浓度10μmoL/L引物NELFA-F/NELFA-R 0.2μL，ddH2O 8.6μL，浓度10ng/μL基因组DNA 1μL；进行PCR采用的反应条件：1)预变性：95.0℃5min；2)扩增反应：变性：95.0℃30sec，退火：60.0℃30sec，延伸：72.0℃45sec，30个循环；72.0℃10min。3)4℃，保存。
5.如权利要求1或2所述的SV40分子标记在香猪产仔数相关的分子标记辅助选择方法中的应用，其特征在于：包括以下步骤：(1)提取香猪的基因组DNA；(2)以上述香猪基因组DNA为模板，利用所述引物NELFA-F和NELFA-R，进行PCR扩增，检测香猪基因组SV40的基因型；3)利用SPSS 20.0软件将结构变异与猪的产仔数进行关联分析；4)根据结构变异SV40进行有高产仔数优势母猪的选育。
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