[发明专利]一种用于鉴定香猪品种的结构变异TRO基因中SV108分子标记及其检测技术在审
| 申请号： | 201910819954.8 | 申请日： | 2019-08-31 |
| 公开（公告）号： | CN110343773A | 公开（公告）日： | 2019-10-18 |
| 发明（设计）人： | 冉雪琴;王嘉福;李升;李大鹏 | 申请（专利权）人： | 贵州大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 贵阳中新专利商标事务所 52100 | 代理人： | 刘艳 |
| 地址： | 550025 贵州省贵*** | 国省代码： | 贵州;52 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 香猪 基因频率 检测技术 结构变异 基因型 分子标记鉴定 分子标记 检测样品 缺失基因 应用结构 基因组 杂合型 基因 纯合 黑猪 参考 应用 发现 | ||
1.一种用于鉴定香猪品种的结构变异TRO基因中SV108分子标记，其特征在于：所述的SV108分子标记是猪基因组中Sscrofa11.1的chrX：47770108-47770216，该区域缺失结构变异108bp片段，或不缺失。
2.根据权利要求1所述的一种用于鉴定香猪品种的结构变异TRO基因中SV108分子标记，其特征在于：所述的SV108标记的引物对为：正向引物SV108F：GGTACAGAAGAAAGACCCCAAGGA，反向引物SV108R：GAAACTAGAACTGGTGCTGGCTG。
3.如权利要求1或2所述的SV108分子标记的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：(1)提取待测大白猪，香猪和黔北黑猪的基因组DNA；(2)以3个待测猪种的基因组DNA为模板，分别利用上、下游引物，进行PCR检测，分析SV的基因型；(3)0.7％琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物，凝胶成像系统记录条带并判断基因型。
4.根据权利要求3所述的SV108分子标记的检测方法，其特征在于：步骤(2)中进行PCR所用的扩增体系，以20μL为例：
2×TaqPCRMasterMix 10.00μL F-primer(0.10μg/μL) 0.40μL R-primer(0.10μg/μL) 0.40μL gDNA 1.00μL 2O]]> 8.20μL TotalVolume 20.00μL
；
PCR反应条件为：
5.如权利要求1或2所述的一种用于鉴定香猪品种的结构变异TRO基因中SV108分子标记的应用方法，其特征在于：包括以下步骤：(1)采用普通PCR技术检测该结构变异在不同猪品种群体中的分布情况；
(2)计算各猪品种中3种基因型在群体中的频率和等位基因的频率，分析该结构变异在香猪与大白猪品种之间的差异大小；
(3)根据结构变异SV320是否为缺失基因型辅助区分大白猪和香猪品种。
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