[发明专利]一种基于JAVA语言的MRI图像并行处理方法及处理系统有效
申请号: | 201910829802.6 | 申请日: | 2019-09-04 |
公开(公告)号: | CN110533573B | 公开(公告)日: | 2023-07-14 |
发明(设计)人: | 黄飞;朱杰;张璐萍;张春雷 | 申请(专利权)人: | 山东华沃医疗科技有限公司 |
主分类号: | G06T1/00 | 分类号: | G06T1/00;G06T7/00 |
代理公司: | 北京中济纬天专利代理有限公司 11429 | 代理人: | 马国冉 |
地址: | 264003 山东省烟台*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 java 语言 mri 图像 并行 处理 方法 系统 | ||
1.一种基于JAVA语言的MRI图像并行处理方法,其特征在于,所述处理方法包括以下步骤:
(1)开始;
(2)上传患者MRI图像DICOM资料压缩包;
(3)解压所述压缩包,获取MRI图像脑结构文件数据,具体包括以下6个步骤:
1)非均匀强度归一化
为了方便进行计算机统一处理,需要消除机器特征,把图像强度归一化到(0,255)范围内,使用基于图像内容特征的灰度归一化方法;
由先验知识获取用张量表示的标记范围图像:
,,其中α,β为机器特征的范围边界;
计算结束后直接置为0和255,根据内容特征各自对应α,β中的部分范围映射到(0,255),在X1,X2,…Xn分别进行归一化;
然后所述标记范围图像的对比度可以表示为:
,
其中, 表示三维空间(i,j,k)位置的第l个特征的强度,=1代表红色,=2代表绿色,=3代表蓝色,=4代表透明度;
是所述标记范围图像的平均强度,表示为:
,
根据磁场成像信号高低,使用m=1,上式变为:
,
;
2)使用卷积三插值算法进行三个方向的精度统一,
,
X,Y,Z三个方向插值变量:x=abs(1-Φx),y=abs(1-Φy),z=abs(1-Φz);
其中,Φx,Φy,Φz分别表示三个方向的精度;
3)进行坐标系空间变换
在DICOM标准中通过Image Position(Patient)-(0020,0032)和Image Orientation(Patient)-(0020,0037)两个字段来确定患者Patient的空间定位;其中Image Position(Patient)表示图像的左上角在空间坐标系中的(x,y,z)坐标,单位是毫米;ImageOrientation(Patient)表示图像坐标与解剖学坐标体系对应坐标夹角的余弦值;为了获得与假设dicom图像中一个体素位置点(x,y,z)对应的位移ΔX、ΔY、ΔZ,设定(,,)为第i个标记点坐标,N为标记点数目,m取2阶样条,则有:
,
、采用上述方法计算;
1)使用mean-shift算法平滑
给定d维空间Rd中的n个样本点xi,i=1,2,3,···,n,在x处的向量基本形式为:
,
其中Sk表示的是数据集的点到x的距离小于球半径h的数据点,也就是
,
通过计算得到漂移向量,更新球圆心x的位置为:
,
每次迭代,使得圆心一直往数据集密度最大的方向移动,找到圆里面点的平均位置作为新的圆心位置,通过加入高斯权重,获得漂移向量计算公式为:
,
计算每次更新的圆心坐标为:
,
使用高斯核做平滑,有:
;
2)区域生长分割算法分割灰质和白质
令R表示整个3d图像矩阵,那么分割可以看成将区域R划分为n个子区域R1,R2,......Rn的过程,并需要满足以下条件:
a: U(Ri) = R;
b: Ri是一个连通区域,i=1,2,3,......n;
c: Ri ∩ Rj = 空集,对于任何的i,j;都有i≠j;
d: P(Ri) = Ture, 对i=1,2,......n;
e: R(Pi U Rj) = False, i≠j;
上述分割必须是以体素为单位进行的分割,否则不能保证被分割对象的连续性,导致分割不完整;为了提高分割过程效率,可以把处理过程转到cuda,处理完成后取出结果;
所述区域生长分割算法分割灰质和白质的处理过程可以转到cuda,处理完成后再取出结果;
3)把分割结果配准到标准分割大脑上
取轴状向量数据f(x,y),将其配准到标准的轴状向量数据f(x′,y′),变换模型为:
,
其中为缩放参数;为旋转角度参数,()为平移参数;
图像小波变换函数为:
,
设定为低通滤波器,为高通滤波器,则通过Mallat算法计算分解数,有:
,
通过伸缩、平移、旋转三种变换把取样图像配准到标准图像,其中伸缩变换计算:
,
平移变换计算:
设p=k-2m,q=l-2n,有:
,
旋转变换计算:
设p=,q=,有:
,
经小波低通滤波变为:
,
经过配准变换后,即可按照标准统计出详细的MRI图像脑结构文件数据;
提取MRI图像脑结构文件数据分析处理;
收集分析处理结果,根据大量统计数据分阶段修正标准模板数据,给出统计分析结果;
结束。
2.一种基于JAVA语言的MRI图像并行处理系统,用于实现权利要求1所述的基于JAVA语言的MRI图像并行处理方法,其特征在于,采用所述基于JAVA语言的MRI图像并行处理方法通过JDK,结合服务器CPU、内存,建立多个子程序,同时处理多个影像资料。
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