[发明专利]MTHFR和MTRR基因多态性检测引物、探针、试剂盒及应用在审
申请号: | 201910841358.X | 申请日: | 2019-09-06 |
公开(公告)号: | CN110423801A | 公开(公告)日: | 2019-11-08 |
发明(设计)人: | 刘永;吴建榕;孙淼 | 申请(专利权)人: | 北京协和洛克生物技术有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京市英智伟诚知识产权代理事务所(普通合伙) 11521 | 代理人: | 刘丹妮;姚望舒 |
地址: | 100176 北京市大*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 引物 多态性检测 探针组合 基因多态性检测 特异性探针 特异性引物 高质量DNA 基因组DNA 多次检测 核酸释放 检测结果 检测试剂 血液样本 样本处理 测序法 常温下 多态性 金标准 灵敏度 热启动 检测 分型 内标 探针 耗时 应用 | ||
1.一种MTHFR和MTRR基因多态性检测引物和探针组合,其特征在于,所述组合包括:
(1)MTHFR C677T基因多态性检测引物与探针组合:包括核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示的MTHFR C677T上游引物、核苷酸序列为SEQ ID NO:2所示的MTHFR C677T下游引物、核苷酸序列为SEQ ID NO:7所示的MTHFR C677T 677C检测探针、核苷酸序列为SEQ ID NO:8所示的MTHFR C677T 677T检测探针;
(2)MTHFR A1298C基因多态性检测引物与探针组合:包括核苷酸序列为SEQ ID NO:3所示的MTHFR A1298C上游引物、核苷酸序列为SEQ ID NO:4所示的MTHFR A1298C下游引物、核苷酸序列为SEQ ID NO:9所示的MTHFR A1298C 1298A检测探针、核苷酸序列为SEQ ID NO:10所示的MTHFR A1298C 1298C检测探针;和
(3)MTRR A66G基因多态性检测引物与探针组合:包括核苷酸序列为SEQ ID NO:5所示的MTRR A66G上游引物、核苷酸序列为SEQ ID NO:6所示的MTRR A66G下游引物、核苷酸序列为SEQ ID NO:11所示的MTRR A66G 66A检测探针、核苷酸序列为SEQ ID NO:12所示的MTRRA66G 66G检测探针;
其中,所述检测探针的5′端标记有FAM或HEX,3′端标记有NFQ-MGB。
2.一种MTHFR和MTRR基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
如权利要求1所述的基因多态性检测引物和探针组合;
内标系统;
核酸释放剂;和
2×PCR反应混合液。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述内标系统包括内标引物和内标探针,所述内标引物包括核苷酸序列为SEQ ID NO:13所示的GAPDH上游引物和SEQ ID NO:14所示的GAPDH下游引物,所述内标探针包括核苷酸序列为SEQ ID NO:15所示的检测探针,其中,所述内标探针5′端修饰有ROX荧光基团,3′端修饰有BHQ2。
4.根据权利要求2或3所述的试剂盒,其特征在于,所述核酸释放剂包括:终浓度为0.1~5%体积分数NP40、100~200mmol/L KCl、5~20mmol/L EDTA、10~20%体积分数BSA、10~30%体积分数DMSO,且所述核酸释放剂的pH值为7.0~8.5;
优选地,所述核酸释放剂包括:终浓度为1%体积分数NP40、150mmol/L KCl、10mmol/LEDTA、15%体积分数BSA、20%体积分数DMSO,且所述核酸释放剂的pH值为8.2。
5.根据权利要求2至4中任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包括三个PCR反应管,其中,每个PCR体系中含有2×PCR反应混合液、如权利要求1所述的引物与探针组合和内标系统。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述每个PCR体系中PCR反应混合液的体积为10μl,所述各引物的体积为0.1μM~1μM,所述各探针的终浓度为50nM~250nM;
优选地,各引物的终浓度为0.1μM,所述各探针的终浓度为100nM。
7.一种MTHFR和MTRR基因多态性检测方法,其特征在于,使用权利要求2至6中任一项所述的试剂盒,所述方法包括以下步骤:
(1)将待测样本加入到所述核酸释放剂中,涡旋充分混匀,室温放置1~30分钟优选为5分钟,瞬时离心备用;
(2)配置PCR反应体系,每个样本的MTHFR和MTRR基因多态性分3管检测;
(3)将配置好的PCR体系放入荧光定量PCR仪中,进行实时荧光定量检测。
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