[发明专利]一种用于FISH的快速标记基因组探针及其制备方法和应用在审
申请号: | 201910868305.7 | 申请日: | 2019-09-16 |
公开(公告)号: | CN110551796A | 公开(公告)日: | 2019-12-10 |
发明(设计)人: | 周勇;唐银 | 申请(专利权)人: | 重庆威斯腾生物医药科技有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/6841 | 分类号: | C12Q1/6841;C12Q1/6806;C12N15/11 |
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地址: | 400039 重庆市九龙坡区二*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 制备 荧光染料标记 探针 蛋白 制备方法和应用 目标基因区域 基因组探针 技术利用 快速标记 快速杂交 细胞形态 假阳性 检测 介导 合成 灵活 | ||
1.一种用于FISH的快速标记基因组探针的制备方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)制备dcas9蛋白:原核表达及纯化得到dcas9蛋白,将荧光染料标记dcas9蛋白;
(2)制备sgRNA库:从NCBI下载目标基因序列,针对目标基因区域保守序列,利用在线网站http : //crispr.mit.edu /分析可能的 sgRNA位点,其中PAM 序列为NGG,在每条sgRNA核心序列的5’端加上19bp的序列如SEQ ID NO.36所示,3’端加上86bp的序列如SEQ IDNO.37所示,得到一系列优化sgRNA序列,化学合成所述优化sgRNA序列,将合成的sgRNA序列连入pUC57-simple质粒,通过质粒PCR扩增、PCR产物体外转录、转录产物纯化,得到一系列sgRNA,即sgRNA库,PCR扩增引物如SEQ ID NO.38、SEQ ID NO.39所示;
(3)构建sgRNA-dcas9酶探针库:将步骤(1)中所得的荧光染料标记的dcas9蛋白分别与步骤(2)中所得的sgRNA库混合组装,所述dcas9蛋白与所述sgRNA库按照摩尔比例为1:1-1:4进行混合组装,即得到sgRNA-dcas9酶探针库。
2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于所述步骤(2)中的PCR扩增体系如下:
。
3.根据权利要求2所述的制备方法,其特征在于所述PCR扩增反应条件为:95℃ 5min;95℃ 30sec,56℃ 30sec,72℃ 30sec,共进行35个循环。
4.一种用于FISH的快速标记基因组探针,其特征在于:根据如权利要求1-3任一项所述的一种用于FISH的快速标记基因组探针的制备方法制备得到。
5.一种快速荧光原位杂交检测试剂盒,其特征在于:含有如权利要求4所述的用于FISH的快速标记基因组探针。
6.根据权利要求5所述试剂盒在制备用于快速荧光原位杂交检测产品中的应用。
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