[发明专利]一种DNA文库构建方法有效

专利信息
申请号: 201910874485.X 申请日: 2019-09-17
公开(公告)号: CN110565174B 公开(公告)日: 2022-09-30
发明(设计)人: 不公告发明人 申请(专利权)人: 北京博昊云天科技有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06
代理公司: 上海一平知识产权代理有限公司 31266 代理人: 徐迅;崔佳佳
地址: 100176 北京市大兴区北京经*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 dna 文库 构建 方法
【权利要求书】:

1.一种DNA文库构建方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)将DNA片段5’末端去磷酸化;其中,所述的DNA片段是具有不同末端的天然DNA;

(2)提供接头混合物,所述接头混合物包括平末端接头和带有不同长度粘末端的接头;其中,所述带有不同长度粘末端的接头的粘末端包括5’粘末端和3’粘末端,且其长度为1-10bp;

(3)使所述接头混合物中接头的5’末端与去磷酸化的DNA片段3’末端连接;

(4)通过切口平移法使接头混合物中接头的3’末端与所述DNA片段5’末端相连;

其中,并且所述带有不同长度粘末端的接头的粘末端为随机核苷酸序列;

所述接头混合物中至少一个接头与DNA相连接的3’末端具有SpC3封闭物或经修饰的核苷酸,所述经修饰的核苷酸是双脱氧胸苷、双脱氧胞苷、双脱氧鸟苷或者双脱氧腺苷。

2.权利要求1所述的DNA文库构建方法,其中,所述经修饰的核苷酸是双脱氧胸苷。

3.权利要求1或2所述的DNA文库构建方法,其中,所述方法在步骤(4)通过切口平移法使接头混合物中接头的3’末端与所述DNA片段5’末端相连之后,还包括步骤(5):对与接头相连接的DNA片段进行扩增。

4.权利要求1所述的DNA文库构建方法,其中,所述带有不同长度粘末端的接头的粘末端的长度为1-9bp,1-8bp,1-7bp,1-6bp,1-5bp,1-4bp,1-3bp,1-2bp或1bp。

5.权利要求1所述的DNA文库构建方法,其中,所述接头混合物中至少一个接头与DNA相连接的3’末端具有SpC3封闭物,并且所述接头的粘末端的长度为2bp或3bp。

6.权利要求1所述的DNA文库构建方法,其中,所述接头混合物中至少一个接头包含单分子标记和/或样本标签。

7.权利要求1所述的DNA文库构建方法,其中所述接头混合物中至少一个接头中与DNA片段相连端相对的另一端被环形序列封闭。

8.权利要求1所述的DNA文库构建方法,其中所述接头混合物中至少一个接头的总长度为21-53bp,21-54bp,21-55bp,21-56bp,21-57bp,22-54bp,23-55bp,24-56bp,25-57bp,21-87bp,22-88bp,23-89bp,24-90bp,25-91bp,26-92bp,27-93bp,28-94bp,29-95bp,或30-96bp。

9.权利要求1所述的DNA文库构建方法,其中所述接头混合物中至少一个接头与DNA相连接的3’末端具有经修饰的核苷酸,所述经修饰的核苷酸是双脱氧胸苷,并且5'突出端的长度为0、1、2、3或4bp。

10.权利要求1所述的DNA文库构建方法,其中在步骤(3)中,通过使用连接酶将所述接头混合物中接头的5’末端与去磷酸化的DNA片段的3’末端相连接。

11.权利要求1所述的DNA文库构建方法,其中在步骤(4)反应前,还包括:往反应物中添加5’端接头单链核苷酸的步骤,其中所述5’端接头单链是指与目标DNA的5’端相连接的单链。

12.一种用于构建DNA文库的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括接头混合物,所述接头混合物包括平末端接头和带有不同长度粘末端的接头;

其中,所述带有不同长度粘末端的接头的粘末端包括5’粘末端和3’粘末端,且其长度为1-10bp;

其中,并且所述带有不同长度粘末端的接头的粘末端为随机核苷酸序列;

所述接头混合物中至少一个接头与DNA相连接的3’末端具有SpC3封闭物或经修饰的核苷酸,所述经修饰的核苷酸是双脱氧胸苷、双脱氧胞苷、双脱氧鸟苷或者双脱氧腺苷。

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