[发明专利]利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法在审
申请号: | 201910875025.9 | 申请日: | 2019-09-17 |
公开(公告)号: | CN110452998A | 公开(公告)日: | 2019-11-15 |
发明(设计)人: | 蔡珊珊;徐胜勇;高天翔 | 申请(专利权)人: | 浙江海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686 |
代理公司: | 33213 杭州浙科专利事务所(普通合伙) | 代理人: | 吴秉中<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
地址: | 316100浙江省舟山市普陀区海*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 线粒体基因组 线粒体DNA 控制区 遗传学分析 靶序列 裂解液 筛查 基因工程技术 二巯基丙醇 甘氨胆酸钠 遗传多样性 肌肉组织 扩增模板 遗传信息 高纯度 上清液 得率 裂解 样本 分析 | ||
1.利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法,其特征在于:包括如下步骤:
在黄鲫肌肉组织样本中加入裂解液进行裂解,然后分离上清液,获得线粒体基因组DNA;
将所述线粒体基因组DNA进行靶序列的筛查;
从筛查结果进行黄鲫遗传学分析;
其中,所述裂解液为包含NaOH、Tris-HCl、EDTA、甘氨胆酸钠和二巯基丙醇的水溶液;
所述靶序列包括线粒体DNA控制区中的整体或部分。
2.根据权利要求1所述的利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法,其特征在于:所述裂解液中NaOH的终浓度0.3-0.4M、Tris-HCl的终浓度0.03-0.05M、EDTA的终浓度4.0-5.0M、甘氨胆酸钠的终浓度6.0-10.0mM,二巯基丙醇的终浓度0.2-0.5mM。
3.根据权利要求1或2所述的利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法,其特征在于:所述线粒体基因组DNA的OD260/OD280在1.83-1.92之间,OD230/OD260在2.12-2.33之间。
4.根据权利要求1或2所述的利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法,其特征在于:所述线粒体基因组DNA的浓度>73.5ng/μL。
5.根据权利要求1所述的利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法,其特征在于:所述筛查使用PCR扩增所述靶序列来实施。
6.根据权利要求5所述的利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法,其特征在于:所述控制区前段高变区引物为:HJ primer-F:5’-CACGCACTTAGCTCCAAGCTA-3’;HJprimer-R:5’-GACGATACCAGAGTAGTGACG-3’。
7.根据权利要求5所述的利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法,其特征在于:所述高变区控制区后半段引物为:HJH primer-F:5’-CAGTCTTCTCTATTCGTCTAG-3’;HJHprimer-R:5’-GTTAGCGAGCTTGATTGCTG-3’。
8.根据权利要求5所述的利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法,其特征在于:所述PCR反应体系:rTaq 0.25μL,DNA模板2μL,primer-F 1μL,primer-R 1μL,DNTP 2μL,10×PCRbuffer 2μL,去离子水16.75μL。
9.根据权利要求5所述的利用线粒体DNA控制区进行黄鲫遗传学分析的方法,其特征在于:所述PCR扩增程序为:95℃变性5min;95℃30s,52℃405s,72℃40s,40个循环;72℃延伸5min,4℃保存。
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