[发明专利]一种适用于细菌FISH检测的杂交缓冲液体系及其原位杂交方法在审

专利信息
申请号: 201910876521.6 申请日: 2019-09-17
公开(公告)号: CN110734964A 公开(公告)日: 2020-01-31
发明(设计)人: 李绪;易婷婷;陈立娟;张高英 申请(专利权)人: 武汉赛维尔生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6841 分类号: C12Q1/6841
代理公司: 42102 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 代理人: 徐晓琴
地址: 430000 湖北省武汉市东湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 杂交缓冲液 细菌 分子杂交检测 原位杂交 甲酰胺 配比为 杂交液 离子 杂交
【说明书】:

发明属于分子杂交检测技术领域,具体涉及一种适用于细菌FISH检测的杂交缓冲液体系及其原位杂交方法。所述杂交缓冲液中各组分的配比为:15%去离子甲酰胺、2×SSC、0.5M EDTA、5×Denhardt、50mMNaH2PO4。本发明所述杂交缓冲液特别适用于细菌类FISH检测,使用本发明所述杂交液进行FISH杂交具有结果特异性高、结果背景低、使用方便、成本低等优点。

技术领域

本发明属于分子杂交检测技术领域,具体涉及一种适用于细菌FISH检测的杂交缓冲液体系及其原位杂交方法。

背景技术

FISH实验是通过碱基互补配对的力学原理,将特异的带有标签的探针序列与目的基因片段互补配对,再通过荧光或者化学反应显示结合点的位置以及数量。

核苷酸探针是原位杂交中检测组织细胞中RNA的一种通用型工具,通常有cRNA,cDNA以及寡核苷酸探针。其中寡核苷酸探针的合成较其他两种更加简单便捷,成本低。特异性的寡核苷酸探针,需要在特定的杂交环境下,控制探针只和靶序列结合。这里就需要杂交液这一工具,并配合杂交温度,利用的是碱基互补配对中退火杂交温度的原理。

绝大部分细菌rRNA序列内都有其特异的一段核酸序列,这段序列即可作为一段特异探针,且由于rRNA在组织内量多且聚集,末端标记荧光素的方式合成的寡核苷酸探针,可达到检测目的。目前文献资料中的应用于细菌FISH的杂交液,普遍含有硫酸葡聚糖,二硫苏糖醇,鲑鱼精DNA等成分,产品成分较多,且效果欠佳。

发明内容

本发明针对现有技术的不足,目的在于提供一种适用于细菌FISH检测的杂交缓冲液体系及其原位杂交方法。

为实现上述发明目的,本发明所采用的技术方案为:

一种适用于细菌FISH检测的杂交缓冲液,各组分配方包括:去离子甲酰胺、SSC、EDTA、Denhardt、NaH2PO4和DEPC水。

上述方案中,所述杂交缓冲液中各组分的配比为:15%(体积比)去离子甲酰胺、2×SSC、0.5M EDTA、5×Denhardt、50mM NaH2PO4

适用于细菌FISH检测的荧光原位杂交方法,包括如下步骤:

(1)组织切片预处理,包括:组织切片固定、脱蜡、水洗、通透、消化;

(2)预杂交:向经步骤(1)预处理后的组织切片滴加所述杂交缓冲液,37℃孵育1小时,倾倒去除杂交缓冲液;

(3)杂交:在组织切片上滴加含标记的寡核苷酸探针的杂交液缓冲液,盖上盖玻片,37℃杂交过夜;

(4)洗涤:用SSC洗脱液洗去杂交液;

(5)复染细胞核及封片,在荧光显微镜下观察荧光信号,采集图像。

上述方案中,所述组织切片脱蜡至水洗的具体过程为:依次将组织切片放入二甲苯Ⅰ15min,二甲苯Ⅱ15min,无水乙醇Ⅰ5min,无水乙醇Ⅱ5min,85%酒精(体积浓度)5min,75%酒精(体积浓度)5min,DEPC水洗。

上述方案中,所述组织切片通透的具体过程为:将组织切片置于1×修复液中90℃、5~10分钟,随后自然冷却;所述修复液为DEPC和水按1:19稀释所得。

上述方案中,所述组织切片消化的的具体过程为:滴加蛋白酶K工作液消化15~20min。

上述方案中,步骤(4)所述洗涤的具体过程为:2×SSC,37℃洗10min;1×SSC,37℃洗2×5min;0.5×SSC室温洗10min。

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