[发明专利]一种叶绿体DNA的富集方法在审
申请号: | 201910876698.6 | 申请日: | 2019-09-17 |
公开(公告)号: | CN110734907A | 公开(公告)日: | 2020-01-31 |
发明(设计)人: | 林芹;龙欢;袁方;陶晔;曾亮;林爱婷 | 申请(专利权)人: | 上海凌恩生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 31260 上海晨皓知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 成丽杰 |
地址: | 201800 上海市嘉*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 叶绿体DNA 测序 富集 细胞核DNA 分子生物学技术 植物基因组DNA 甲基化位点 测序数据 植物细胞 准确度 蛋白A 磁珠 修饰 媒介 | ||
1.一种叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,包括:
(1)提取植物基因组DNA;
(2)使蛋白A修饰的磁珠与MBD2-Fc蛋白结合,得到处理后的磁珠;
(3)将所述植物基因组DNA加入所述处理后的磁珠中,混匀,对混合物进行室温下孵育;
(4)对孵育后的混合物离心,于磁力架上静置,细胞核DNA通过与磁珠上的MBD2-Fc蛋白结合而附着到磁珠上,叶绿体DNA保留在上清液中,取上清液;
(5)使用磁珠对所述上清液中的叶绿体DNA进行回收,即得到富集后的叶绿体DNA。
2.根据权利要求1所述的叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,步骤(1)中,在提取植物基因组DNA时,保证所述植物基因组DNA的完整性,并且完全去除植物蛋白。
3.根据权利要求1所述的叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,步骤(1)中,提取植物基因组DNA的方法为:对待提取样本使用蛋白酶K处理,然后用酚氯仿或酒精提取。
4.根据权利要求1所述的叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,步骤(1)中,还包括对提取的植物基因组DNA进行质量检测的步骤和/或对提取的植物基因组DNA进行纯化的步骤。
5.根据权利要求4所述的叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,所述对提取的植物基因组DNA进行质量检测的步骤包括浓度检测、有无降解检测、杂质检测中的一种或多种。
6.根据权利要求1所述的叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,步骤(2)中,所述蛋白A为从A型金黄色葡萄球菌分离得到的细胞壁蛋白。
7.根据权利要求1所述的叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,步骤(2)中,使蛋白A修饰的磁珠与MBD2-Fc蛋白结合的方法为:取蛋白A修饰的磁珠与MBD2-Fc蛋白混合,室温中孵育10~15分钟。
8.根据权利要求1所述的叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,步骤(2)中还包括除去未结合的MBD2-Fc蛋白的步骤。
9.根据权利要求1所述的叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,步骤(3)中,加入到所述处理后的磁珠中的植物基因组DNA的总量不超过1μg。
10.根据权利要求1所述的叶绿体DNA的富集方法,其特征在于,步骤(3)中,所述室温下孵育的时间为15~20分钟。
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