[发明专利]一种筛选肿瘤特异性T细胞及TCR的方法在审
申请号: | 201910876889.2 | 申请日: | 2019-09-17 |
公开(公告)号: | CN110675914A | 公开(公告)日: | 2020-01-10 |
发明(设计)人: | 罗微;毛晓帆;余思菲;张贝莹;林凯容;金亚彬 | 申请(专利权)人: | 佛山市第一人民医院(中山大学附属佛山医院) |
主分类号: | G16B25/10 | 分类号: | G16B25/10;G16B50/00;G06K9/62;G01N33/569;C12Q1/6869 |
代理公司: | 44205 广州嘉权专利商标事务所有限公司 | 代理人: | 朱继超 |
地址: | 528000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肿瘤特异性 死细胞 筛选 测序 去除 免疫磁珠 肿瘤抗原 肿瘤组织 转录 抗原 建库 流式 浸润 样本 肿瘤 消化 组建 分析 | ||
1.一种筛选肿瘤特异性T细胞及TCR的方法,其特征在于,所述方法具体步骤为:
(1)首先将肿瘤组织进行浸润单细胞消化分离;
(2)然后从分离的单细胞中流式分选出CD3+T细胞;
(3)利用免疫磁珠去除流式分选出CD3+T细胞中的死细胞;
(4)将去除死细胞后的CD3+T细胞进行单细胞转录组建库、VDJ建库及测序;
(5)将测序后的数据进行分析,然后筛选肿瘤特异CD8+T细胞及TCR。
2.根据权利要求书1中所述的筛选肿瘤特异性T细胞及TCR的方法,其特征在于,所述步骤(1)的具体操作步骤为:
(a)首先将离体手术切除肿瘤组织置于无菌平皿内,利用无菌PBS或Hank’s溶液将肿瘤组织进行反复冲洗,并减去结缔组织和脂肪组织,然后将肿瘤组织剪碎;
(b)在剪碎的肿瘤组织中加入组织消化液混匀于37℃摇床消化1-2h;
(c)将消化后的肿瘤组织中加入HBSS溶液终止消化,使用移液管将组织液转移至70μm筛网中过滤至离心管中,1800r/min,离心8min;
(d)将离心后的组织液弃去上清液,用Hank’s溶液洗涤,然后离心弃掉上清液,加入培养液重悬细胞,计数细胞。
3.根据权利要求书1中所述的筛选肿瘤特异性T细胞及TCR的方法,其特征在于,所述步骤(2)的具体操作步骤为:
①将计数为10-50×106个组织浸润单个核细胞,离心后弃掉上清,用纯化缓冲液清洗,然后1800rpm/min 4℃离心8min;
②将离心后的上清液弃掉,用200μL纯化缓冲液将沉淀细胞重悬,加入荧光抗体,4℃避光孵育30min后,用纯化缓冲液清洗,然后1800rpm/min 4℃离心8min,弃掉上清,用500μL纯化缓冲液将沉淀细胞重悬;
③将细胞重悬液经40μm的筛网过滤去除粘连的细胞团块,然后将过滤的细胞重悬液经7-AAD染料进行表面分子染色,利用BD Aria II收集射门于单细胞中的7-AAD-CD45-V450+CD3-PE-CF594+细胞群。
4.根据权利要求书1中所述的筛选肿瘤特异性T细胞及TCR的方法,其特征在于,所述步骤(3)的具体操作为:将流式分选的CD3+T细胞进行离心,然后用无菌PBS洗涤,然后取45-55μL无菌PBS重悬细胞,取等量的细胞悬液和胎盘蓝混合,利用Life Count细胞计数仪计数细胞及细胞活率,细胞活率<80%利用美天旎磁珠去死细胞磁珠做去死细胞处理。
5.根据权利要求书1中所述的筛选肿瘤特异性T细胞及TCR的方法,其特征在于,所述步骤(4)的具体操作为:利用磁珠标签技术标记去除死细胞后获得的单细胞,使同一个细胞的每条RNA都标记上同样的标签,逆转录和酶切后,分别进行转录组和VDJ扩增,最后对扩增的转录组和VDJ进行测序。
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