[发明专利]一种粪便中血吸虫DNA提取方法及其快速鉴定LF-RPA方法有效
申请号: | 201910883777.X | 申请日: | 2019-09-19 |
公开(公告)号: | CN110499311A | 公开(公告)日: | 2019-11-26 |
发明(设计)人: | 朱传刚;纪荣毅;沈元曦;周志平;冒丽;刘冀 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院上海兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心上海分中心);尼沃诺斯(苏州)生物工程有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806;C12Q1/6804;C12Q1/6888 |
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地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 血吸虫 诊断 寄生虫虫卵 曼氏血吸虫 日本血吸虫 基层单位 检测结果 快速鉴定 感染 吸虫 粪便 防治 | ||
1.一种粪便中血吸虫DNA提取方法,所述方法为:
(1)取感染血吸虫的动物粪便置于小烧杯中,加入RO水,玻璃棒搅拌均匀;
(2)用100目和180目铜筛网过滤,反复冲洗后收集180目铜筛网上的粪便于量杯中,注满生理盐水,室温下静置,弃上清,取沉淀涂片计数虫卵;
(3)将沉淀转移至小研钵中,倒入少量液氮冷冻,待液氮挥发完以后,进行研磨,反复倒入液氮冷冻研磨,如此反复三次;将研磨后显微镜下观察有无完整虫卵,如有继续研磨;
(4)将研磨后粉末仔细刮入1.5mlEP管中,加蛋白酶K,混匀将研磨后粉末仔细刮入1.5mlEP管中,加蛋白酶K,混匀;
(5)加入缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置;
(6)加入无水乙醇,充分震荡颠倒混匀,此时会出现絮状沉淀,瞬离取出管盖内壁水珠;
(7)将上述液体和絮状物转移至吸附柱中,吸附柱放入收集管中,离心,倒掉废液,将吸附柱放入收集管中;
(8)向吸附柱加入漂洗液PW,离心,倒掉废液,将吸附柱放入收集管中,重复此步骤两次;
(9)将吸附柱放入收集管中,离心,倒掉废液,将吸附柱置于室温放置,彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液;
(10)将吸附柱转移至一个新的1.5mlEP管中,向吸附膜中央悬空滴加洗脱液TE,室温放置,离心,吸附柱弃掉,盖上EP管,做好标记,放入-20℃冰箱保存。
2.一种基于粪便中分离出的DNA的LF-RPA检测试剂盒,所述试剂盒中包括:
用于检测日本血吸虫的引物对和探针,所述引物对上游引物的核苷酸序列为TCTACTAAAACCGCGCACTAAGTTGTATATTGG(SEQ ID NO.7),下游引物的核苷酸序列为Biotin-TTCCTTATTTTCACAAGGTGAAGTCAAGCG(SEQ ID NO.8);所述探针的核苷酸序列为 FAM-AACGTTCGATCGTTATGTCAAATAGGACAA(THF) AGGCAT CCTTAGCCAT G-C3-spacer(SEQ IDNO.9);
用于检测曼式血吸虫的引物对和探针,所述引物对上游引物的核苷酸序列为AT CTGAAT CCG ACC AAC CGT TCT ATG AAA ATC G(SEQ ID NO.10),下游引物的核苷酸序列为Biotin -ATATTAACGCCCACGCTCTCGCAAATAATCTA AAAC(SEQ ID NO.11);所述探针的核苷酸序列为 FAM- ACCAACCGTTCTATGAAAATCGTTGTATCT(THF)CGAAACCACTGGACTTTTTATG -C3-spacer(SEQ ID NO.12);
用于检测东毕吸虫的引物对和探针,所述引物对上游引物的核苷酸序列为TTTAGCTTGGAGTATAGTGGTATGTCTTTTTTAG(SEQ ID NO.13),下游引物的核苷酸序列为Biotin-TATATTTGGTTTCCTTTGCTATAAACCAAAGG(SEQ ID NO.14);所述探针的核苷酸序列为 FAM-AATGATGTTTGTCTTTAGTTGGTTGTCTTC (THF) ATTATTTTTATTAGTAGGTTC3-spacer(SEQ IDNO.15)。
3.如权利要求2所述的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括以下组成成分:LF-RPA引物探针混合液,LF-RPA反应预混液,PCRD试纸条和PCRD试纸条缓冲液PCRDextraction buffer;所述LF-RPA引物探针混合液中,引物的核苷酸序列如权利要求1中所述,探针的核苷酸序列为权利要求1所述。
4.根据权利要求2所述的检测试剂盒在检测、鉴定日本血吸虫,曼式血吸虫,东毕吸虫中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,检测方法包括以下步骤:
1)对待检测核酸样品进行重组酶聚合酶扩增;
扩增时所使用的引物对和探针为:
用于检测日本血吸虫的引物对和探针,所述引物对上游引物的核苷酸序列为TCTACTAAAACCGCGCACTAAGTTGTATATTGG(SEQ ID NO.7),下游引物的核苷酸序列为Biotin-TTCCTTATTTTCACAAGGTGAAGTCAAGCG(SEQ ID NO.8);所述探针的核苷酸序列为 FAM-AACGTTCGATCGTTATGTCAAATAGGACAA(THF) AGGCAT CCTTAGCCAT G-C3-spacer(SEQ IDNO.9);
用于检测曼式血吸虫的引物对和探针,所述引物对上游引物的核苷酸序列为AT CTGAAT CCG ACC AAC CGT TCT ATG AAA ATC G(SEQ ID NO.10),下游引物的核苷酸序列为Biotin -ATATTAACGCCCACGCTCTCGCAAATAATCTA AAAC(SEQ ID NO.11);所述探针的核苷酸序列为 FAM- ACCAACCGTTCTATGAAAATCGTTGTATCT(THF)CGAAACCACTGGACTTTTTATG -C3-spacer(SEQ ID NO.12);
用于检测东毕吸虫的引物对和探针,所述引物对上游引物的核苷酸序列为TTTAGCTTGGAGTATAGTGGTATGTCTTTTTTAG(SEQ ID NO.13),下游引物的核苷酸序列为Biotin-TATATTTGGTTTCCTTTGCTATAAACCAAAGG(SEQ ID NO.14);所述探针的核苷酸序列为 FAM-AATGATGTTTGTCTTTAGTTGGTTGTCTTC (THF) ATTATTTTTATTAGTAGGTTC3-spacer(SEQ IDNO.15) ;
2) 将待检测核酸样品,LF-RPA引物探针混合液,缓冲液、醋酸镁溶液等混于反应管中;将RPA反应体系缓慢涡旋混匀,放置与37℃水浴锅中充分反应20min,在冰上停止反应;将LF-RPA扩增产物移取2μl到灭菌离心管中,加入98μl的运行缓冲液,充分涡旋混匀后,将10μl样品稀释液滴加至侧流层析免疫试纸条末端,并将侧流层析试纸条迅速转移到含有200μl反应缓冲液的1.5mlEP管中,室温孵育5-10min,观察结果;如果试纸条同时出现检测线和控制线,表明该粪样含有相应的血吸虫DNA;如果试纸条只出现控制线,则该粪样不含对应的血吸虫DNA;同时阴性对照试纸条只出现控制线,不出现检测线。
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