[发明专利]用于检测宫颈癌相关基因甲基化的检测试剂盒及其使用方法有效
申请号: | 201910898042.4 | 申请日: | 2019-09-23 |
公开(公告)号: | CN110578001B | 公开(公告)日: | 2023-04-11 |
发明(设计)人: | 马淑燕;田慧珍;黎道娇 | 申请(专利权)人: | 广州滴纳生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 戴志攀 |
地址: | 510700 广东省广州市黄*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 宫颈癌 相关 基因 甲基化 试剂盒 及其 使用方法 | ||
1.一组引物探针在制备用于检测宫颈癌风险的试剂盒中的应用,其特征在于,引物探针由内参引物对和内参探针、用于检测FAM19A4基因甲基化的第一引物对和第一探针、用于检测EPB41L3基因甲基化的第二引物对和第二探针以及用于检测PAX1基因甲基化的第三引物对和第三探针组成;其中,所述第一引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ IDNO.2所示,所述第一探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述第二引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示,所述第二探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,所述第三引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示,所述第三探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;所述内参引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.10和SEQID NO.11所示,所述内参探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述第一探针、所述第二探针和所述第三探针的5’端均连接有荧光报告基团,且所述第一探针、所述第二探针和所述第三探针的荧光报告基团互不相同,所述第一探针、所述第二探针和所述第三探针的3’端均连接有荧光淬灭基团。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述荧光报告基团选自FAM、JOE、VIC、HEX、ROX、CY3或CY5,所述荧光淬灭基团选自BHQ、TAMRA或MGB。
4.根据权利要求1~3任一项所述的应用,其特征在于,还包括PCR缓冲液、dNTPs、MgCl2、UNG酶、Taq DNA聚合酶、阳性质控品和阴性质控品中的一种或多种。
5.根据权利要求1~3任一项所述的应用,其特征在于,包括以下使用步骤:
使用所述第一引物对、所述第一探针、所述第二引物对、所述第二探针、所述第三引物对、所述第三探针与亚硫酸盐转化后的待测DNA样本配制PCR反应体系,然后进行荧光定量PCR反应。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述荧光定量PCR反应的条件为:49℃~51℃ UNG酶反应1min~3min;94℃~96℃变性4min~6min;94℃~96℃变性4s~6s,54℃~56℃退火延伸34s~36s并收集荧光信号,45个循环。
7.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,还包括分析荧光定量PCR数据的步骤,所述分析荧光定量PCR数据的方法包括以下步骤:分别获取PAX1基因的Ct值、FAM19A4基因的Ct值和EPB41L3基因的Ct值与内参基因的Ct值之间的差值,根据差值判断对应基因的甲基化检测结果。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述根据差值判断对应基因的甲基化检测结果的方法为:以FAM19A4、EPB41L3和PAX1基因对应的三个△Ct值中最小的△Ct值作为判断标准,当△Ct≦9.0时结果为阳性,说明具有宫颈癌风险高;当△Ct9.0或未检出时结果为阴性,说明具有宫颈癌风险低。
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