[发明专利]一种用于检测乳腺癌HER2拷贝数变异的数字PCR方法及检测试剂盒

权利要求书

1.一种用于检测乳腺癌HER2拷贝数变异的检测试剂盒，其特征在于：包括用于检测HER2基因拷贝数变异的引物及其相配套的探针，和用于检测的内参基因的一对引物及其相配套的一条探针；所述内参基因为RPPH1基因，用于检测的内参基因RPPH1的引物为P1，其序列如SEQ ID NO: 10和SEQ ID NO:11所示，其探针的序列如SEQ ID NO:12 所示；

根据HER2基因的总长度和外显子分布，分别针对7、16、24号外显子的序列，设计了用于检测HER2基因拷贝数变异的三对引物H1、H2、H3及其相配套的三条探针，H1的序列如SEQ IDNO:1和SEQ ID NO:2所示；H2的序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示；H3的序列如SEQ IDNO:5和SEQ ID NO:6所示；其探针的序列如SEQ ID NO:7、SEQID NO:8、SEQID NO:9所示；HER2的7号、16号和24号外显子的引物浓度在300 nM，探针的浓度均为300 nM。

2.根据权利要求1所述的检测试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括：

(a)第一容器，以及位于所述容器内的用于特异性扩增含HER2基因的特异引物对和探针；

(b)第二容器，以及位于所述容器内的用于特异性扩增含HER2基因的特异引物对和探针；

(c)第三容器，以及位于所述容器内的用于特异性扩增含HER2基因的特异引物对和探针；

(d)第四容器，以及位于所述容器内的用于特异性扩增含RPPH1基因的特异引物对和探针。

3.一种引物和配套探针在制备用于检测乳腺癌HER2拷贝数变异的检测试剂盒中的应用，其特征在于：包括用于检测HER2基因拷贝数变异的引物及其相配套的探针，和用于检测的内参基因的一对引物及其相配套的一条探针；所述内参基因为RPPH1基因，用于检测的内参基因RPPH1的引物为P1，其序列如SEQ ID NO: 10和SEQ ID NO:11所示，其探针的序列如SEQ ID NO:12 所示；

用于检测HER2基因拷贝数变异的三对引物H1、H2、H3及其相配套的三条探针，其中，H1的序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示；H2的序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示；H3的序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示；其探针的序列如SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9所示。