[发明专利]一种快速提取石蜡组织RNA的方法在审
申请号: | 201910953885.X | 申请日: | 2019-10-09 |
公开(公告)号: | CN110819622A | 公开(公告)日: | 2020-02-21 |
发明(设计)人: | 杨俊;范明胶;何靖;李勐黎 | 申请(专利权)人: | 广州达正生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星;朱聪聪 |
地址: | 510725 广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 提取 石蜡 组织 rna 方法 | ||
1.一种快速提取石蜡组织RNA的试剂盒,其特征在于,包括以下组分:
脱蜡混合液bufferAL:0.5~1.5%的tween-20(V/V)、5~15mM的Tris·Cl;
裂解液buffer RLT:400~600mM的Tris·Cl,15~25mM的EDTA,质量分数0.1~1%的SDS,80~120mM的DTT;
DNase I工作混合液:8~12mM的Tris·Cl、0.1Mm的CaCl2、8~12mM的MnCl2和DNase I0.5~7.5U/μL;
纯化液1:1~5%Chelex-100(m/v,g/ml),溶剂为TE缓冲液;
纯化液2:4~7%Chelex-100(m/v,g/ml),溶剂为DEPC处理水;
蛋白酶K。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述的脱蜡混合液bufferAL包含体积分数1%的tween-20,10mM的Tris·Cl。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述的裂解液buffer RLT包含500mM的Tris·Cl,20mM的EDTA,质量分数0.5%的SDS,100mM的DTT。
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述的DNase I工作混合液包含10mMTris·Cl,0.1Mm CaCl2,10mM MnCl2、0.5U/μLDNase I。
5.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述的纯化液1包括5%g/ml的Chelex-100,溶剂为TE缓冲液。
6.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述的纯化液2包括6%g/ml的Chelex-100,溶剂为DEPC水。
7.一种快速提取石蜡组织RNA的方法,其特征在于,是利用权利要求1、2、3、4、5或6所述的试剂盒进行提取,具体方法如下:
A、脱蜡:将FFPE样品置于脱蜡混合液bufferAL中进行脱蜡;
B、组织的裂解:将脱蜡后的样品用裂解液buffer RLT和蛋白酶K裂解,得裂解液;
C、纯化:裂解液中加入纯化液1,混匀孵育,离心取上清,将上清转入新的管中,再加入氯仿混匀,离心取上清转入新的管中,得到纯化液;
D、RNA分离:在纯化液中加入DNase I工作混合液,混匀孵育,再加入纯化液2,混匀孵育,离心取上清至无RNase离心管中,得到RNA。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,具体步骤如下:
A、脱蜡:
刮取1片10μm厚、面积约1×1cm2的FFPE样品至1.5mL离心管中,加入100μl脱蜡混合液bufferAL,将贴在管壁上的组织全部浸入其中,90℃孵育10min;
B、组织的裂解
(1)加入120μl裂解液buffer RLT,2μl Proteinase K使得其终浓度为10mg/L涡旋震荡混匀56℃孵育15min 400rpm,直至样品完全溶解.80℃孵育15min,离心,使管壁上的溶液收集到管底;
C、纯化
(1)加入100μl纯化液1,轻轻混匀,99℃450rmp孵育10min,立即放在冰上静置2min,10500xg离心15min;
(2)转移上清至新的EP管中金属浴加热至45℃后,加入100μl氯仿充分混匀后,10500xg离心15min,吸取上清180μl至新的EP管中;
D、RNA分离
(1)在步骤C的(2)的含有上清的新的EP管中加入2μl DNase I工作混合液,使用移液器吹打混匀,37孵育15min,94℃孵育5min;
(2)加入100μl纯化液2,轻轻混匀,100℃450rmp孵育15min,10500xg离心15min,转移180μl上清至新的无RNase离心管中。
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