[发明专利]一种数字PCR检测布鲁氏菌核酸DNA的方法在审
申请号: | 201910955795.4 | 申请日: | 2019-10-09 |
公开(公告)号: | CN111733217A | 公开(公告)日: | 2020-10-02 |
发明(设计)人: | 田国忠 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/01 |
代理公司: | 北京思海天达知识产权代理有限公司 11203 | 代理人: | 张立改 |
地址: | 102206 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 数字 pcr 检测 布鲁氏菌 核酸 dna 方法 | ||
1.一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,配置PCR反应体系,经过预处理后,在一定的PCR反应条件下,使用PCR仪,进行PCR扩增,扩增结果使用微滴分析仪,进行分析判断;所述PCR反应体系,包括:待检样品核酸DNA、2╳ddPCR Supermix、引物、探针和双蒸馏水。
2.按照权利要求1所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,待检测样品核酸DNA为各种可用的试剂盒提取的核酸DNA。
3.按照权利要求1所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,引物和探针,根据布鲁氏菌特异编码bscp31蛋白基因的核苷酸序列,应用软件分别设计布鲁氏菌特异的引物和探针,其物核苷酸序列如下所示:
正向引物:F1:5’-ACCTTGCCCTTGCCATCAT-3’,SEQ ID NO:1;
反向引物:R1:5’-AGTCCGGCTTTACGCAGTCA-3’,SEQ ID NO:2;
探针序列:Probe:5’-TGCCGTTATAGGCCCAATAGGCAACG-3’,SEQ ID NO:3,其中,5’端标记荧光基团FAM,3’端使标记淬灭基团BHQ-1。
4.按照权利要求1所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,PCR反应体系包括:2╳ddPCR Supermix 10μL;待检核酸DNA 1μL;正向引物F1和反向引物R1各1.6μL,探针Probe 0.8μL,补水至20μL。
5.按照权利要求4所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,引物和探针溶液的浓度皆为10μmol/L。
6.按照权利要求1所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,PCR反应体系预处理过程如下:
(1)制备微滴:将20μL PCR反应体系和70μL的微滴生成油加入到微滴生成卡槽内,盖上胶垫,放入微滴生成仪中产生微滴;
(2)封膜:将微滴生成仪中产生微滴约40μL,用移液枪转移到96孔PCR板中,盖上锡纸膜,用封膜仪将96孔PCR板封膜;
(3)将封膜的PCR板,放在PCR仪中运行。
7.按照权利要求6所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,数字PCR扩增条件为:95℃预变性10min;95℃变性30s,退火温度59℃,1min,循环40次;98℃酶失活10min。
8.按照权利要求6所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,PCR扩增结果使用微滴分析仪,进行分析判断,将96孔PCR板放在微滴分析仪中读取荧光信号,通过软件对结果进行分析,阳性对照和阴性对照成立的前提下,计数阳性微滴数,即核酸DNA的拷贝数。
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