[发明专利]一种数字PCR检测布鲁氏菌核酸DNA的方法在审

专利信息
申请号: 201910955795.4 申请日: 2019-10-09
公开(公告)号: CN111733217A 公开(公告)日: 2020-10-02
发明(设计)人: 田国忠 申请(专利权)人: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851;C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/01
代理公司: 北京思海天达知识产权代理有限公司 11203 代理人: 张立改
地址: 102206 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 数字 pcr 检测 布鲁氏菌 核酸 dna 方法
【权利要求书】:

1.一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,配置PCR反应体系,经过预处理后,在一定的PCR反应条件下,使用PCR仪,进行PCR扩增,扩增结果使用微滴分析仪,进行分析判断;所述PCR反应体系,包括:待检样品核酸DNA、2╳ddPCR Supermix、引物、探针和双蒸馏水。

2.按照权利要求1所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,待检测样品核酸DNA为各种可用的试剂盒提取的核酸DNA。

3.按照权利要求1所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,引物和探针,根据布鲁氏菌特异编码bscp31蛋白基因的核苷酸序列,应用软件分别设计布鲁氏菌特异的引物和探针,其物核苷酸序列如下所示:

正向引物:F1:5’-ACCTTGCCCTTGCCATCAT-3’,SEQ ID NO:1;

反向引物:R1:5’-AGTCCGGCTTTACGCAGTCA-3’,SEQ ID NO:2;

探针序列:Probe:5’-TGCCGTTATAGGCCCAATAGGCAACG-3’,SEQ ID NO:3,其中,5’端标记荧光基团FAM,3’端使标记淬灭基团BHQ-1。

4.按照权利要求1所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,PCR反应体系包括:2╳ddPCR Supermix 10μL;待检核酸DNA 1μL;正向引物F1和反向引物R1各1.6μL,探针Probe 0.8μL,补水至20μL。

5.按照权利要求4所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,引物和探针溶液的浓度皆为10μmol/L。

6.按照权利要求1所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,PCR反应体系预处理过程如下:

(1)制备微滴:将20μL PCR反应体系和70μL的微滴生成油加入到微滴生成卡槽内,盖上胶垫,放入微滴生成仪中产生微滴;

(2)封膜:将微滴生成仪中产生微滴约40μL,用移液枪转移到96孔PCR板中,盖上锡纸膜,用封膜仪将96孔PCR板封膜;

(3)将封膜的PCR板,放在PCR仪中运行。

7.按照权利要求6所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,数字PCR扩增条件为:95℃预变性10min;95℃变性30s,退火温度59℃,1min,循环40次;98℃酶失活10min。

8.按照权利要求6所述的一种数字PCR技术检测布鲁氏菌核酸DNA的方法,其特征在于,PCR扩增结果使用微滴分析仪,进行分析判断,将96孔PCR板放在微滴分析仪中读取荧光信号,通过软件对结果进行分析,阳性对照和阴性对照成立的前提下,计数阳性微滴数,即核酸DNA的拷贝数。

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