[发明专利]基于核酸飞行质谱筛查多种遗传病SNP的方法及所用引物在审
申请号: | 201910981250.0 | 申请日: | 2019-10-16 |
公开(公告)号: | CN110628895A | 公开(公告)日: | 2019-12-31 |
发明(设计)人: | 陈亮;何杨;焦爽丽;岳平 | 申请(专利权)人: | 重庆市人口和计划生育科学技术研究院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 33212 杭州中成专利事务所有限公司 | 代理人: | 金祺 |
地址: | 400020*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 飞行质谱 核酸 遗传病 筛查 引物 单碱基延伸引物 分子生物学领域 甲基丙二酸血症 肝豆状核变性 四氢生物蝶呤 苯丙酮尿症 高胱氨酸尿 基因多态性 遗传性疾病 反向引物 突变位点 基因 缺乏症 一次性 检测 | ||
1.基于核酸飞行质谱筛查多种遗传病SNP所用引物,其特征在于:为针对如下6种遗传病的7个基因进行设计:alpha/beta地贫,甲基丙二酸血症,四氢生物蝶呤缺乏症,高胱氨酸尿症,肝豆状核变性,苯丙酮尿症;
引物包括PCR正、反向引物以及单碱基延伸引物。
2.根据权利要求1所述的基于核酸飞行质谱筛查多种遗传病SNP所用引物,其特征在于:PCR正、反向引物如下表1所述;
表1、6种疾病7个基因的共159的引物序列
3.根据权利要求1或2所述的基于核酸飞行质谱筛查多种遗传病SNP所用引物,其特征在于:所述单碱基延伸引物如下表2所述;
表2、159个位点的延伸引物
4.利用如权利要求1~3任一所述的引物进行的基于核酸飞行质谱筛查多种遗传病SNP的方法,其特征是依次进行如下步骤:
1)、PCR扩增:
PCR扩增体系:PCR缓冲液、MgCl2、dNTP、0.1μM的PCR引物、PCR高保真酶、待测样本的DNA,水定容至5μL;
表1中编号(表1中第1列所述)相同的PCR引物在一个PCR体系中反应;
PCR扩增体系:
2)、SAP反应:
在步骤1)所得的PCR扩增中加入含SAP酶的SAP混液形成SAP反应体系;所述SAP反应体系中SAP酶的浓度为0.5U/ul;
反应程序:
37℃40分钟
85℃5分钟
4℃保温。
3)、延伸反应:
在步骤2)反应所得物中加入含延伸引物混合物和iPLEX酶的iPLEX延伸混液形成延伸反应体系;
表2中编号(表2中第1列所述)相同的延伸引物混合在一起形成延伸引物混合物;循环反应程序:
4)、将步骤3)所得的反应结果在核酸飞行质谱仪进行检测。
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