[发明专利]一种基于Gompertz模型的卵形鲳鲹体质量育种方法有效
申请号: | 201911001582.4 | 申请日: | 2019-10-18 |
公开(公告)号: | CN110771547B | 公开(公告)日: | 2021-06-29 |
发明(设计)人: | 张殿昌;刘宝锁;江世贵;郭华阳;张楠;郭梁;朱克诚 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院南海水产研究所 |
主分类号: | A01K61/95 | 分类号: | A01K61/95 |
代理公司: | 广州知友专利商标代理有限公司 44104 | 代理人: | 宣国华 |
地址: | 510300 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 gompertz 模型 卵形 体质 育种 方法 | ||
1.一种基于Gompertz模型的卵形鲳鲹体质量育种方法,其特征在于,测定卵形鲳鲹选育群体的多次体质量数据,建立每尾鱼体体质量的Gompertz模型,计算每尾鱼体的体质量生长速率最优值,结合微卫星标记构建的加性遗传相关矩阵,计算每尾鱼体的体质量生长速率育种值,根据体质量生长速率育种值选留候选亲本,并设计候选亲本的交配方案,完成卵形鲳鲹体质量育种;
所述加性遗传相关矩阵是利用提取卵形鲳鲹选育群体和其亲本的DNA样品,利用多重微卫星鉴定个体间亲缘关系结果构建;
所述体质量生长速率育种值是通过线性混合模型估计体质量生长速率的方差组分和遗传力,再根据体质量生长速率遗传力采用BLUP法计算每尾鱼体的体质量生长速率育种值;
所述体质量生长速率遗传力通过以下线性混合模型估算得到,其具体模型为yi=μ1+ai+ei,式中,yi为第i个鱼体的体质量生长速率,μ1为所有鱼体的体质量生长速率均值,ai为第i个鱼体的加性遗传效应,其服从期望均值为0和方差为的多元正态分布,其中A为加性遗传相关矩阵,为加性遗传方差,ei为第i个鱼体的随机残差效应,其服从期望均值为0和方差为的多元正态分布,其中I为单位矩阵,为残差方差;根据模型获得的和数值,计算体质量生长速率的遗传力(h2),其计算公式为
2.根据权利要求1所述基于Gompertz模型的卵形鲳鲹体质量育种方法,其特征在于,Gompertz模型具体形式为式中,yij为第j个时间点第i个鱼体的体质量数值,Ai为第i个鱼体的体质量最大理论生长极限,Bi为第i个鱼体的初始体质量,ki为第i个鱼体的体质量生长速率,tj为第j个时间点。
3.根据权利要求2所述基于Gompertz模型的卵形鲳鲹体质量育种方法,其特征在于,Gompertz模型中参数的最终估计值是以Levenberg-Marquardt迭代法进行迭代运算结束时收敛的数值。
4.根据权利要求1所述基于Gompertz模型的卵形鲳鲹体质量育种方法,其特征在于,卵形鲳鲹选育群体的亲本是卵形鲳鲹选育F3代个体。
5.根据权利要求4所述基于Gompertz模型的卵形鲳鲹体质量育种方法,其特征在于,测定卵形鲳鲹选育群体多次体质量数据的方法是通过利用PIT电子标记进行个体标记,定期测量每尾标记鱼体体质量数据;所述定期测量每尾标记鱼体体质量数据是每隔1个月测量一次标记鱼体的体质量数据,至少测量4次以上。
6.根据权利要求1所述基于Gompertz模型的卵形鲳鲹体质量育种方法,其特征在于,根据体质量生长速率育种值选留候选亲本是将鱼体的体质量生长速率育种值按大小进行排序,选择体质量生长速率育种值较大的前10%鱼体进行留种或通过后裔测定方法挑选出体质量生长速率育种值较大鱼体的雌性和雄性亲本,并进行特定交配受精,进行下一代鱼苗繁育。
7.根据权利要求6所述基于Gompertz模型的卵形鲳鲹体质量育种方法,其特征在于,选择体质量生长速率育种值较大的前10%鱼体进行留种时,设计交配方案是使得交配方案中亲本间交配子代近交系数控制在0.1以内。
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