[发明专利]在体筛选具有潜在微生物调节能力的药物的方法在审

专利信息
申请号: 201911015923.3 申请日: 2019-10-24
公开(公告)号: CN110643686A 公开(公告)日: 2020-01-03
发明(设计)人: 杨朝勇;王炜;吴秋月;林丽缘 申请(专利权)人: 上海交通大学医学院附属仁济医院
主分类号: C12Q1/6841 分类号: C12Q1/6841;C12Q1/689;C12N15/11;G01N21/64;C12Q1/04
代理公司: 31234 上海衡方知识产权代理有限公司 代理人: 卞孜真
地址: 200001 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 细菌 肠道菌群 特异性标记 荧光物质 广谱 微生物调节 代谢活性 细菌生长 药物活性 原位标记 组合标记 荧光 代谢 筛选 施加 统计 分析
【说明书】:

发明提供了一种在体的对具有潜在微生物调节能力的药物进行筛选的体系,用于评价不同药物对肠道菌群活性的影响,所述药物能够抑制或促进细菌生长代谢,其步骤包括:药物施加时或之后,利用细菌广谱荧光物质原位标记肠道菌群,所述细菌广谱荧光物质能够特异性标记细菌;分离肠道菌群,利用细菌特异性标记物质或其组合标记不同种属细菌,统计肠道菌群中细菌广谱荧光物质和细菌特异性标记物质组合的荧光强度用于分析不同种属细菌的代谢活性,以得出药物活性结果。

技术领域

本发明涉及医药技术或检测领域,特别是涉及在体筛选具有潜在微生物调节能力的药物的方法,用于体内筛选调节微生物代谢药物的方法,用于评价药物影响肠道菌群活性,所述药物能够抑制或促进肠道细菌生长代谢。

背景技术

肠道菌群在动物和人的肠道内以极高的密度存在,这些菌群发挥了众多的功能,而其菌群活性反映了生命机体的健康状况,各类药物使用是否对肠道菌群产生影响以及对具体细菌产生某种影响,通常采用动物实验结合深度细菌DNA测序并综合复杂的生物信息学分析以得知药物服用后对菌群中各种类型细菌相对组分变化的影响情况。但此方法存在测序繁琐、成本高、数据分析难度大、不精确(只能反映细菌相对丰度的变化情况)、不灵敏(即使是死细菌,只要有相应的DNA分子在,也存在被测出的可能)等问题。

近期发表的文章中所使用的STAMP技术(A strategy using sequential taggingwith D-amino acid-based metabolic probes)[参考文献1],即是带有荧光基团标记的DAA探针标记供体小鼠的肠道菌群,取出被标记的肠道菌群灌给受体小鼠,再用不同的荧光基团标记的DAA探针标记受体小鼠的肠道菌群,取受体小鼠的肠道菌群,之后利用荧光显微镜或者流式细胞仪对两种探针双标的细菌进行分析,可以得出植入菌在受体体内存活的比例,这种技术主要应用于评判移植菌在体内的代谢活性,未涉及使用可以用于评估筛选各类药物对肠道菌群代谢活性的影响。而本发明中的技术方案主要应用于评估筛选评价各类药物对肠道菌群中各类细菌代谢活性的影响。

发明内容

本发明提供了用于评估、评价药物的方法,具体是评估、评价影响肠道细菌代谢的药物。

本发明一方面涉及在体筛选具有潜在微生物调节能力的药物的方法,所述药物能够抑制或促进细菌生长代谢,其步骤包括:

药物施加时或之后,利用细菌广谱荧光物质原位标记肠道菌群,所述细菌广谱荧光物质能够特异性标记细菌;

分离肠道菌群,利用细菌特异性标记物质组合标记不同种属细菌,统计肠道菌群中细菌广谱荧光物质和细菌特异性标记物质或其组合的荧光强度用于分析不同种属细菌的代谢活性,以得出药物活性结果。

优选地,所述细菌广谱荧光物质通过代谢标记方式标记细菌;优选的,所述细菌广谱荧光物质在肽聚糖合成和\或代谢时取代正常氨基酸;更优选的,所述细菌广谱荧光物质为带有荧光基团的D-型氨基酸,最优选为D-型氨基酸-Cy5。

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