[发明专利]针对NOTCH通路蛋白的SRM/MRM分析在审
| 申请号： | 201911032319.1 | 申请日： | 2019-10-28 |
| 公开（公告）号： | CN111122686A | 公开（公告）日： | 2020-05-08 |
| 发明（设计）人： | 托德·哈姆布拉夫;法比奥拉·切基;S·施瓦兹;K·斯科特 | 申请（专利权）人： | 爱科谱迅病理研究公司 |
| 主分类号： | G01N27/62 | 分类号： | G01N27/62;G01N33/574 |
| 代理公司： | 北京润平知识产权代理有限公司 11283 | 代理人： | 刘依云;乔雪微 |
| 地址： | 美国马*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 针对 notch 通路 蛋白 srm mrm 分析 | ||
1.一种测定福尔马林固定组织的生物样品中蛋白质水平的方法，该方法包括：
通过质谱检测和/或定量来自所述生物样品的蛋白质消化物中的一种或多种修饰或未修饰片段肽的量；以及计算所述样品中所述蛋白质的水平；
其中所述蛋白质选自由以下各项组成的组中：DLL1蛋白、DLL3蛋白、JAG1蛋白、JAG2蛋白、Notch1蛋白、Notch2蛋白、Notch3蛋白、Notch4蛋白和DLL4蛋白。
2.根据权利要求1所述的方法，进一步包括在检测和/或定量所述一种或多种修饰或未修饰片段肽的量之前分离所述蛋白质消化物的步骤。
3.根据权利要求2所述的方法，其中，所述分离步骤选自由以下各项组成的组中：液相色谱、纳米反相液相色谱、高效液相色谱和反相高效液相色谱。
4.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质消化物包括蛋白酶消化物。
5.根据权利要求4所述的方法，其中，所述蛋白质消化物包括胰蛋白酶消化物。
6.根据权利要求1所述的方法，其中，所述质谱包括串联质谱、离子阱质谱、三重四级杆质谱、离子阱/四级杆混合质谱、MALDI-TOF质谱、MALDI质谱和/或飞行时间质谱。
7.根据权利要求6所述的方法，其中，所用的质谱的模式是选择反应监测(SRM)、多反应监测(MRM)、多选择反应监测(mSRM)和/或智能选择反应监测(iSRM)。
8.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质是DLL1，且所述一种或多种片段肽是SEQ ID NO：1和/或SEQ ID NO：2所示的肽。
9.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质是DLL3，且所述一种或多种片段肽是SEQ ID NO：3和/或SEQ ID NO：4所示的肽。
10.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质是JAG1，且所述一种或多种片段肽是SEQ ID NO：5和/或SEQ ID NO：6所示的肽。
11.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质是JAG2，且所述一种或多种片段肽是SEQ ID NO：7和/或SEQ ID NO：8所示的肽。
12.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质是Notch1，且所述一种或多种片段肽是SEQ ID NO：9和/或SEQ ID NO：10所示的肽。
13.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质是Notch2，且所述一种或多种片段肽是SEQ ID NO：11和/或SEQ ID NO：12所示的肽。
14.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质是Notch3，且所述一种或多种片段肽是SEQ ID NO：13和/或SEQ ID NO：14所示的肽。
15.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质是Notch4，且所述一种或多种片段肽是SEQ ID NO：15和/或SEQ ID NO：16所示的肽。
16.根据权利要求1所述的方法，其中，所述蛋白质是DLL4，且所述一种或多种片段肽是SEQ ID NO：17和/或SEQ ID NO：18所示的肽。
17.根据权利要求1所述的方法，其中，所述组织是石蜡包埋的组织。
18.根据权利要求1所述的方法，其中，所述组织获自肿瘤。
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