[发明专利]一种中华绒螯蟹双顺反子病毒的RT-PCR检测方法在审
申请号: | 201911048843.8 | 申请日: | 2019-10-31 |
公开(公告)号: | CN110592288A | 公开(公告)日: | 2019-12-20 |
发明(设计)人: | 周阳;鲍胜华;谢国兴;陈正锦;贡成良;冯永杰;薛仁宇;曹广力;胡小龙 | 申请(专利权)人: | 盐城市大丰区水产技术推广站 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686 |
代理公司: | 32218 南京天华专利代理有限责任公司 | 代理人: | 闫世巍 |
地址: | 224100 江苏省盐城*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 双蒸水 溶解 待检样品 总RNA 保温 阳性对照PCR管 退火 双顺反子病毒 中华绒螯蟹 扩增条件 反转录 预变性 延伸 变性 混匀 扩增 合成 | ||
1.一种中华绒螯蟹双顺反子病毒的RT-PCR检测方法,其特征在于:按以下步骤进行:
(1)取50-100mg待检组织,提取组织总RNA;
(2)待检样品的反转录管用19μL无RNase的双蒸水溶解,加1μL 提取的总RNA,42度保温60分钟,75度保温10分钟;
(3)待检样品PCR管加24μL双蒸水溶解后,加1μL合成的cDNA,混匀;
(4)阳性对照PCR管中,加25μL双蒸水溶解;
(5)将步聚(3)、(4)的PCR管进行PCR扩增,扩增条件为:93-95度预变性3分钟后,按94度变性30秒、50-57度退火30秒、72度延伸20-25秒,共扩增25-35个循环,最后72度延伸10分钟;
(6)PCR反应结束后,取8-10μL反应产物用琼脂糖凝胶电泳进行分离,尔后在紫外观察仪下观察,如果待检样品和阳性对照均可观察到0.29kb的特异性条带,则可判别为待检样品中含有中华绒螯蟹双顺反子病毒,如果待检样品中没有观察到0.29kb的特异性条带,而阳性对照中可观察到0.29kb的特异性条带,则可判别为待检样品中无中华绒螯蟹双顺反子病毒。
2.根据权利要求1所述的一种中华绒螯蟹双顺反子病毒的RT-PCR检测方法,其特征在于:述的待检样品的反转录管按以下方法制备:取5×反转录缓冲液4μL、4dNTPs Mix(每一种dNTP的终浓度为2.5mM) 4.0μL、RNA酶抑制剂(40U/μL) 0.5μL,250pmol/L引物1μL、禽成髓细胞瘤病毒反转录酶AMV (10U/μL) 1μL,在离心管中混匀后,冻干,保存于-20度,其中引物的序列如SEQ ID NO2,
SEQ ID NO2: GCTGCGCGAGTGCATCCCAC。
3.根据权利要求1所述的一种中华绒螯蟹双顺反子病毒的RT-PCR检测方法,其特征在于:述的待检样品PCR管按以下方法制备:取10×PCR缓冲液2.5μL、4dNTPs Mix(每一种dNTP的终浓度为2.5mM) 2.5μL、250pmol/L引物对各1μL、MgCl2(25mM) 1.5μL、Taq DNA 聚合酶(5U/μL) 0.3μL混匀后,冻干,于-20度保存,其中的引物对序列如SEQ ID NO1和SEQ IDNO2,
SEQ ID NO1:
TGAGCAGGCGATCCAACTAC,
SEQ ID NO2:
GCTGCGCGAGTGCATCCCAC。
4.根据权利要求1所述的一种中华绒螯蟹双顺反子病毒的的RT-PCR检测方法,其特征在于:述的阳性对照PCR管按以下方法制备:取10×PCR缓冲液2.5μL、4dNTPs Mix(每一种dNTP的终浓度为2.5mM) 2.5μL、250pmol/L引物对各1μL、MgCl2(25mM) 1.5μL、Taq DNA 聚合酶(5U/μL) 0.3μL加入至含有10ng阳性质粒的PCR管中, 混匀后冻干,-20度保存;其中阳性质粒中含有中华绒螯蟹双顺反子病毒的特异性序列如SEQ ID NO3,SEQ ID NO3:
TGAGCAGGCGATCCAACTACGCGCCGATGTTGATGATGCCATAAGGCGATGTCGTGAGGATGAGCCCATTGAGGTCATCTGGATAGACACCCTTAAGGATGAGCGCCGATCCCACGAGAAGGTCGATGCTGGCAAGACTAGGATCATTTCTAATGGTCCCATGCACATCAACATTGCCTTCCGCATGTATTTCATGGCCGCGCTGGCGCATCTGCGTGCTGGTCGCATATACAACGGAATTGCTGTGGGCATCAACGTGTGGAGTCGCGAGTGGGATGCACTCGCGCAGC。
5.根据权利要求1所述的一种中华绒螯蟹双顺反子病毒的的RT-PCR检测方法,其特征在于:所述待检组织为血淋巴、肌肉或肝胰腺,所述组织总RNA的提取按常规的Trizol方法进行。
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