[发明专利]一种红斑丹毒丝菌的检测方法及其引物和探针在审
申请号: | 201911060271.5 | 申请日: | 2019-11-01 |
公开(公告)号: | CN110878337A | 公开(公告)日: | 2020-03-13 |
发明(设计)人: | 赵福振;罗宝正;沙才华;黄海超;廖秀云;陈轩;邵建宏 | 申请(专利权)人: | 拱北海关技术中心 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 张志辉 |
地址: | 519000 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 红斑 丹毒 检测 方法 及其 引物 探针 | ||
1.一种检测红斑丹毒丝菌的引物,其特征在于,所述引物的序列为:
F-引物:5’-CCGAATTTGCTTACCGCTTGAAGGTTAAAGCAGGC-3’,
R-引物:5’-GTCCAAATTGAATAGTTTTCTATATACATAAGATC-3’。
2.一种检测红斑丹毒丝菌的探针,其特征在于,所述探针的序列为:
探针:5’-AGGTCTAGCGCAGATCGAGGGTAAGTACAATAATCTCCAAAAGATAA-3’;
所述探针上标记有荧光基团、淬灭基团和THF,所述荧光基团与所述淬灭基团均标记在T碱基上,所述荧光基团与所述淬灭基团的间距为1~5nt;所述荧光基团与所述淬灭基团之间设有所述THF,所述THF距所述探针5’端≥30nt,所述THF距所述探针3’端≥15nt。
3.根据权利要求2所述的探针,其特征在于,所述荧光基团包括FAM、TET、HEX、CY3或JOE,所述淬灭基团包括BHQ1、BHQ2、TAMRA、DABCYL、MGB或Eclipse。
4.根据权利要求2所述的探针,其特征在于,所述探针的3’末端还标记有修饰基团。
5.根据权利要求4所述的探针,其特征在于,所述修饰基因包括胺基、磷酸基团、生物素-TEG、巯基或C3-spacer。
6.一种用于检测红斑丹毒丝菌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物和权利要求2至5中任一项所述的探针。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阳性标准品和阴性标准品。
8.一种非诊断目的的红斑丹毒丝菌的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取样品DNA;
(2)以所述样品DNA为模板,利用权利要求1所述的引物和权利要求2至5中任一项所述的探针进行实时荧光重组酶介导核酸扩增检测;
(3)收集荧光信号,得出样品检测结果。
9.根据权利要求8所述的检测方法,其特征在于,所述样品DNA的OD260/280为1.8~2.0。
10.根据权利要求8所述的检测方法,其特征在于,所述RAA检测的反应程序为:39℃40s,1个循环;39℃30s,30~40个循环。
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