[发明专利]一种人血浆RASSFlA基因甲基化检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201911080821.X | 申请日: | 2019-11-07 |
公开(公告)号: | CN110669842A | 公开(公告)日: | 2020-01-10 |
发明(设计)人: | 赵晨阳;杨金波;张斌 | 申请(专利权)人: | 上海中科生物医学高科技开发有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 31334 上海段和段律师事务所 | 代理人: | 李慧;郭国中 |
地址: | 201100 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因启动子区 创伤性 试剂盒 检测 甲基化特异性 甲基化检测 手术标本 特异性强 位点设计 甲基化 检出率 人血浆 富集 引物 | ||
1.一种人血浆RASSFIA基因甲基化检测试剂盒,其特征在于,包括:针对人RASSFIA基因启动子区中CpG富集位点设计的序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的甲基化特异性引物对。
2.根据权利要求1所述的人血浆RASSFIA基因甲基化检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括血浆收集试剂、血浆游离DNA提取试剂、血浆游离DNA的CT转换处理试剂和荧光定量MSP扩增试剂。
3.根据权利要求2所述的人血浆RASSFIA基因甲基化检测试剂盒,其特征在于,
所述血浆收集试剂含:抗凝剂;
所述血浆游离DNA提取试剂含:裂解液GHH、Proteinase K、Carrier RNA、磁珠、缓冲液、漂洗液、洗脱缓冲液;
所述血浆游离DNA的CT转换处理试剂含:CT Conversion粉剂、M-Dilution Buffer、M-Dissolving Buffer、水、M-Binding buffer、M-Wash Buffer、M-Desulphonation Buffe、HPLC级水;
所述荧光定量MSP扩增试剂含:2×multiplex PCR premix、序列如SEQ ID No.1和SEQID No.2所示的引物对、序列如SEQ ID No.3所示的荧光探针和无菌水。
4.一种如权利要求1-3中任一项所述的人血浆RASSFIA基因甲基化的检测试剂盒在评估RASSFlA基因在血浆肿瘤循环DNA中的含量中的应用。
5.一种如权利要求1-3所述的检测试剂盒进行人血浆RASSFIA基因甲基化的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
A、将采集的血样进行预处理;
B、将经预处理后的血浆采用磁珠法进行提取获得血浆游离DNA;
C、采用亚硫酸氢盐法将血浆游离DNA进行化学修饰,再进行CT转换处理后重新提取DNA;
D、将步骤C处理后获得的DNA样本进行荧光定量MSP检测;
E、以标准品血浆DNA的扩增结果制定外标准曲线,对待测样本进行定量结果分析。
6.根据权利要求5所述的人血浆RASSFIA基因甲基化的检测方法,其特征在于,步骤A中,所述预处理具体方法包括:
A1、将采集的血样与抗凝剂充分混匀后,离心,吸取白细胞层上方5mm的血浆至EP管中;
A2、将血浆再次离心,吸取至新EP管中,并检测血浆的溶血、脂血状态。
7.根据权利要求5所述的人血浆RASSFIA基因甲基化的检测方法,其特征在于,步骤B中,所述采用磁珠法进行提取获得血浆游离DNA具体方法包括:
B1、将经预处理后的血浆、裂解液、Proteinase K和Carrier RNA在离心管中混合均匀后加入磁珠,震荡混匀,室温孵育;
B2、步骤B1处理后进行磁珠吸附处理,待磁珠完全吸附时去除液体;
B3、经步骤B2处理后在离心管中加入缓冲液,上下颠倒混匀,使磁珠充分悬浮;
B4、将离心管再进行磁珠吸附处理,待磁珠完全吸附时去除液体;
B5、经步骤B4处理后在离心管中加入漂洗液,上下颠倒混匀,是磁珠充分悬浮;
B6、重复步骤B4和B5;
B7、将离心管再进行磁珠吸附处理,待磁珠完全吸附时去除液体,然后室温晾干;
B8、经步骤B7处理后在离心管中加入洗脱缓冲液,使磁珠重新悬浮,孵育,使核酸充分洗脱;
B9、将步骤B8处理后在进行磁珠吸附处理,待磁珠完全吸附时将含核酸的液体移出,即可。
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