[发明专利]100bp DNA分子量标准物的制备方法、引物组及其应用有效

专利信息
申请号: 201911107232.6 申请日: 2019-11-13
公开(公告)号: CN110714053B 公开(公告)日: 2023-03-10
发明(设计)人: 傅向阳 申请(专利权)人: 生工生物工程(上海)股份有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12N15/11
代理公司: 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 代理人: 覃蛟
地址: 201600 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 100 bp dna 分子量 标准 制备 方法 引物 及其 应用
【说明书】:

发明提供了一种100bp DNA分子量标准物的制备方法、引物组及其应用,涉及生物技术领域。该制备方法包括使用第一引物、第二引物和搭桥引物,经PCR扩增得到100bp DNA分子量标准物;第一引物为如SEQ ID NO.1所示序列,或为和SEQ ID NO.1所示序列90%以上同源性的序列;第二引物为如SEQ ID NO.2所示序列,或为和SEQ ID NO.2所示序列90%以上同源性的序列;搭桥引物的3’端含有与第一引物的3’端10~15bp的反向碱基互补序列;搭桥引物的5’端含有与第二引物的3’端10~15bp的重复序列;PCR扩增产物的长度为100bp。该制备方法操作简单,经济高效。

技术领域

本发明涉及生物技术领域,尤其是涉及一种100bp DNA分子量标准物的制备方法、引物组及其应用。

背景技术

脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA)是一类大分子物质,通常作为遗传信息的载体,对DNA的研究在生命科学研究中占据重要的地位。

电泳是常用于核酸检测的方法。琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在琼脂糖凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就提供了很好的分辨能力。鉴于琼脂糖凝胶电泳的特性,其常被用于DNA的检测。

在电泳实验时,常用已知分子量大小的DNA样品作为参照物,以帮助实验人员迅速判断检测DNA分子量的大小,这些已知分子量大小的DNA就是DNA分子量标准物。通常将分子量大小不同的DNA片段混合起来作为标准参照物,以方便实验检测。这些混合好的DNA分子量标准物常被叫做DNA Marker,除向生物技术公司购买外,实验室也可以根据需要自行配制。

目前常用的DNA Marker有两种,一种是质粒或病毒DNA经过酶切获得的,片段的分子量大小有零有整,如Lambda DNA经限制性内切酶EcoR I酶切得到6条带,其大小分别为21226bp、7421bp、5804bp、5643bp、4878bp和3530bp,Lambda DNA经限制性内切酶Hind III酶切则得到另外大小不同的8条带;另外一种是固定数值的,比如100bp、200bp、500bp、1000bp、2000bp、10000bp等,它通常是先制备固定分子量的DNA分子量标准物,然后再混合而成,通过选择不同的DNA分子量标准物混合得到不同的DNA marker产品。这后一种DNAmarker产品更方便用于对比观察,因而更常用。

配制DNA marker产品,首先需要制备固定分子量的DNA分子量标准物。目前主要采用两种方法,一种是常规PCR扩增,即采用模板(常用的模板为质粒,因其容易制备)和引物,PCR反应扩增出固定分子量的DNA分子量标准物如500bp、1000bp、2000bp等片段;另一种是酶切法,即先构建合适的质粒,提取质粒后再通过限制性内切酶酶切,得到固定分子量的DNA分子量标准物。比如,构建好一个3000bp的质粒,通过对质粒上单一的限制性酶切位点切割得到3000bp的DNA分子量标准物,也可以在质粒上设计多个位点,酶切后得到多个DNA分子量标准物,采用这种方法后续的纯化步骤会比较复杂。

但对于小分子量的DNA分子量标准物如100bp DNA片段的制备,上述两种方法均不理想。质粒的自身结构决定了其至少有1000bp以上长度,能酶切出100bp大小片段的质粒即便构建出来,后续的制备工艺也很复杂;常规PCR扩增方法倒是简单,但实验中发现,小片段扩增效率低,用常规PCR法来制备100bp DNA片段并不经济。因而,寻找一种简单、高效且经济的100bp DNA分子量标准物的制备方法显得十分必要。

有鉴于此,特提出本发明。

发明内容

本发明的第一目的在于提供一种100bp DNA分子量标准物的制备方法,该制备方法操作简单,经济高效。

本发明的第二目的在于提供一组引物组,该引物组经PCR反应能够合成100bp DNA分子。

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