[发明专利]一种活化的嗜碱性粒细胞的表达谱及其构建方法和应用在审
申请号: | 201911146487.3 | 申请日: | 2019-11-20 |
公开(公告)号: | CN111304293A | 公开(公告)日: | 2020-06-19 |
发明(设计)人: | 潘庆军;刘华锋;陈小群;廖淑珍;陆兴;招春飞;杨陈 | 申请(专利权)人: | 广东医科大学附属医院 |
主分类号: | C12Q1/6811 | 分类号: | C12Q1/6811;A61K45/00;A61P37/08;A61P37/02 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 郝传鑫;王兰兰 |
地址: | 524001 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 活化 碱性 粒细胞 表达 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一种活化的嗜碱性粒细胞的转录组表达谱的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)嗜碱性粒细胞的制备、活化和培养,其中,嗜碱性粒细胞的活化采用Anti-IgE刺激;
2)抽提步骤1)活化后的嗜碱性粒细胞细胞总RNA,进行全转录组测序,得到Anti-IgE组细胞mRNA、lncRNA、circRNA、microRNA测序数据;
3)全转录组表达谱的鉴定:采集未活化的嗜碱性粒细胞mRNA、lncRNA、circRNA、microRNA原始数据,使用Agilent GeneSpring GX v12.1软件进行芯片标准化,建立Control组与步骤2)所得Anti-IgE组细胞mRNA、lncRNA、circRNA、microRNA表达谱;
对比Control组与Anti-IgE组RNAs的标准化值,以差异倍数变化、P-value为差异筛选阈值,筛选出差异表达的RNAs,即得所述活化的嗜碱性粒细胞的转录组表达谱。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤1)中采用负选的方法从正常人抗凝的外周血中制备嗜碱性粒细胞。
3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤1)中,采用无血清培养基于37℃含5%的CO2培养箱中培养活化后的嗜碱性粒细胞12~48小时。
4.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤1)中Anti-IgE的浓度为10μg/mL。
5.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤3)中,mRNA相应的差异倍数变化为大于或等于2。
6.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤3)中,lncRNA相应的差异倍数变化为大于或等于3。
7.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤3)中,circRNA相应的差异倍数变化为大于或等于1.5。
8.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤3)中,microRNA相应的差异倍数变化为大于或等于50。
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