[发明专利]rRNA捕获探针及其应用有效
| 申请号： | 201911152414.5 | 申请日： | 2019-11-22 |
| 公开（公告）号： | CN110878298B | 公开（公告）日： | 2023-09-15 |
| 发明（设计）人： | 王君文;胡琪;苏锦玲;高飞 | 申请（专利权）人： | 深圳市易基因科技有限公司 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 深圳市徽正知识产权代理有限公司 44405 | 代理人： | 卢杏艳 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市坪山区坑梓街道秀*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | rrna 捕获 探针 及其 应用 | ||
1.一种蓝细菌的rRNA捕获探针，其特征在于，其由如下三组rRNA捕获探针混合后制成；其中，
5SrRNA探针序列组由SEQ ID No.1和SEQ ID No.2组成；
16SrRNA探针序列组由SEQ ID No.3至SEQ ID No.24组成；
23SrRNA探针序列组由SEQ ID No.25至SEQ ID No.76组成；
每条rRNA捕获探针的长度范围为30bp-120bp；相邻的rRNA捕获探针之间的长度间距小于30bp。
2.根据权利要求1所述的rRNA捕获探针，其特征在于，所述rRNA捕获探针还包括生物素标记。
3.一种全转录组测序检测方法，其特征在于，应用如权利要求1所述的rRNA捕获探针捕获并去除样本总RNA中的rRNA。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，每种rRNA捕获探针的摩尔浓度为0.1uM-1uM；所述样本总RNA的投入量为50ug-10ng，浓度大于等于5ng/uL。
5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，每种所述rRNA捕获探针的摩尔浓度为0.5uM。
6.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，应用所述的rRNA捕获探针捕获并去除样本总RNA中的rRNA，具体包括：
在杂交缓冲体系中，将所述rRNA捕获探针与所述样本总RNA进行杂交，形成DNA-RNA杂合链；
在杂交完成后，在核糖核酸酶H的作用下，特异性的消化DNA-RNA杂合链中的rRNA；
在脱氧核糖核酸酶I的作用下，特异性的消化所述rRNA捕获探针。
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