[发明专利]一种快速突变Y染色体STR分型系统、下一代测序分型试剂盒及分型方法和应用有效
申请号: | 201911206540.4 | 申请日: | 2019-11-29 |
公开(公告)号: | CN110846420B | 公开(公告)日: | 2023-06-02 |
发明(设计)人: | 李淑瑾;丛斌;陈璐;王嘉茜;马春玲;卢朝龙 | 申请(专利权)人: | 河北医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6869 |
代理公司: | 石家庄国为知识产权事务所 13120 | 代理人: | 张沙沙 |
地址: | 050017 河*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 突变 染色体 str 系统 下一代 测序分型 试剂盒 方法 应用 | ||
1.一种快速突变Y染色体STR下一代测序分型试剂盒,其特征在于:所述下一代测序分型试剂盒包括下一代测序定制panel试剂盒,所述下一代测序定制panel试剂盒中包括扩增19个基因座的68条PCR扩增特异性引物,所述PCR扩增特异性引物的核苷酸序列如SEQ IDNO.1~SEQ ID NO.68所示,所述19个基因座为DYS630、DYS464、DYF403S1a、DYF403S1b1、DYF403S1b2、DYF399S1、DYS518、DYS527、DYS713、DYS612、DYS627、DYS526a、DYS526b、DYF404S1、DYF387S1、DYS449、DYS547、DYS570、DYS576。
2.根据权利要求1所述的快速突变Y染色体STR下一代测序分型试剂盒,其特征在于:所述下一代测序定制panel试剂盒还包括FuPa试剂、Ampliseq CD Indexes和Lib Amp Mix。
3.根据权利要求1所述的下一代测序分型试剂盒,其特征在于:所述下一代测序分型试剂盒还包括MiSeq上机测序试剂。
4.一种快速突变Y染色体STR下一代测序分型方法,其特征在于:用权利要求1~3任一项所述快速突变Y染色体STR下一代测序分型试剂盒进行样品检测。
5.根据权利要求4所述的快速突变Y染色体STR下一代测序分型方法,其特征在于:所述方法至少包括以下操作步骤:
步骤a、提取待测血液的DNA,定量,采用上述试剂盒中的68条PCR扩增特异性引物构建文库;
步骤b、对所述文库进行片段检测,定量;
步骤c、根据步骤b的定量结果,对文库中的样本进行均一化,然后变性、稀释,测序;
步骤d、将测序结果进行序列对比,得到分型结果。
6.根据权利要求5所述的快速突变Y染色体STR下一代测序分型方法,其特征在于:步骤a中构建文库的操作包括靶片段扩增,扩增子部分消化,连接标签接头序列,文库一次清洗,文库扩增,文库二次清洗;所述靶片段扩增的引物为所述68条扩增特异性引物;和/或
步骤c中所述稀释为将所述文库的样本浓度稀释至18pM;和/或
步骤c中所述测序的操作在Illumina MiSeq FGx平台进行。
7.根据权利要求6所述的快速突变Y染色体STR下一代测序分型方法,其特征在于:所述靶片段扩增的PCR反应循环参数为:99℃,2min;99℃,15s,60℃,4min,21次循环;10℃,4min~24h;和/或
所述扩增子部分消化的方法为用FuPa试剂进行扩增子部分消化,消化的参数为:50℃,10min;55℃,10min;62℃,20min;10℃,<1h;和/或
所述文库扩增的程序为:98℃,2min;98℃,15s,64℃,1min,7次循环;10℃,4min~24h。
8.权利要求4~7任一项所述的快速突变Y染色体STR下一代测序分型方法在鉴别男性同卵双生子中的应用。
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