[发明专利]一种干巴菌土壤菌丝体含量的测定方法在审
申请号: | 201911210929.6 | 申请日: | 2019-12-02 |
公开(公告)号: | CN111020051A | 公开(公告)日: | 2020-04-17 |
发明(设计)人: | 沙涛;杨小雨;张亚平 | 申请(专利权)人: | 云南大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12Q1/04;C12R1/645 |
代理公司: | 北京市盈科律师事务所 11344 | 代理人: | 仲英豪 |
地址: | 650091*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 干巴 土壤 菌丝体 含量 测定 方法 | ||
1.一种干巴菌土壤菌丝体含量的测定方法,其特征在于,具体步骤如下:
(1)在干巴菌生长地,用5点法,取以子实体为中心半径5cm,深度14cm的土壤,每2cm为一个土壤深度,共7个不同深度的土壤样品装入准备好的无菌取样袋中,进行编号,将土样保存在-80℃;
(2)将步骤(1)的土壤进行DNA提取,所得的液体为土壤真菌DNA混合液体,将提取到的土壤真菌DNA混合液体放到-20℃备用;
(3)步骤(2)提取的DNA采用引物Tg进行qPCR试验,将检测到的Ct值代入标准曲线方程式y=-4.639x+11.396,其中y是qPCR试验检测到的Ct值,x是菌丝体含量。
2.根据权利要求1所述干巴菌土壤菌丝体含量的测定方法,其特征在于,步骤(2)DNA提取使用的是凯杰公司的DNA Isolation Kit。
3.根据权利要求1所述干巴菌土壤菌丝体含量的测定方法,其特征在于,步骤(3)qPCR试验反应程序为:95℃预变性2min;然后95℃变性10s,58℃退火15s,72℃延伸1min,共40次循环后终止反应。
4.根据权利要求1所述干巴菌土壤菌丝体含量的测定方法,其特征在于,步骤(3)标准曲线方程式y=-4.639x+11.396的求取方法:
(1)提取干巴菌的DNA;
(2)以步骤(1)中提取的DNA为模板,用引物Tg进行PCR扩增,得到扩增产物;
(3)步骤(2)中扩增产物经切胶回收、连接腺嘌呤、连接载体,然后进行菌液PCR实验,并提取质粒,将所提取的3份质粒,分别稀释到50ng/μL,然后再依次稀释十倍,共稀释7个浓度梯度,分别为:5ng/μL、0.5ng/μL、0.05ng/μL、0.005ng/μL、0.0005ng/μL、0.00005ng/μL、0.000005ng/μL,进行qPCR实验确定最适的浓度梯度为:0.5ng/μL、0.05ng/μL、0.005ng/μL、0.0005ng/μL、0.00005ng/μL;再用最适的浓度进行qPCR实验,重复两遍,最终确定标准曲线方程式为:y=-4.639x+11.396,其中y是qPCR试验检测到的Ct值,x是菌丝体含量。
5.根据权利要求1或4所述干巴菌土壤菌丝体含量的测定方法,其特征在于,引物Tg的核苷酸序列为Tg1:5’-ACCTGTGCACCCTCTGTAGTTCC-3’,如SEQ ID NO:1所示;Tg2:5’-GTCCAAGCTCATCATGGCA-3’,如SEQ ID NO:2所示,该引物为干巴菌多拷贝基因ITS的特异性引物。
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