[发明专利]基于去SUMO化酶和SAX的SUMO化肽段富集方法有效
申请号: | 201911212642.7 | 申请日: | 2019-12-02 |
公开(公告)号: | CN112980908B | 公开(公告)日: | 2022-08-09 |
发明(设计)人: | 张丽华;李洋;单亦初;杨开广;梁振;张玉奎 | 申请(专利权)人: | 中国科学院大连化学物理研究所 |
主分类号: | C12P21/06 | 分类号: | C12P21/06;C07K1/18 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 郑伟健 |
地址: | 116023 辽宁省*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 sumo sax 化肽段 富集 方法 | ||
1.基于去SUMO化酶和阴离子交换色谱SAX的SUMO化肽段富集方法,步骤包括:
1)封闭多肽中N末端和侧链的自由氨基;所述的封闭多肽中N末端和侧链的自由氨基,具体步骤如下:
将蛋白质的碱性位点酶切后产生的多肽样品溶解于pH为6-10的缓冲液中,加入终浓度10-4000 mM的氨基活性试剂,反应1-48 h后,将溶液除盐,冻干,得到样品A;所述的蛋白质的碱性位点酶切采用的酶为胰蛋白酶,蛋白内切酶Lys-C,蛋白内肽酶Arg-C中的一种或二种以上;氨基活性试剂为醛类、酸酐类、卤化物、胍基化试剂、琥珀酰化试剂、Traut’s试剂中的一种或二种以上;
2)采用阴离子交换色谱SAX预富集多肽中保留的SUMO化肽段;
3)再对收集到的SUMO化肽段用去SUMO化酶进行去SUMO化;
4)将样品再一次经过阴离子交换色谱SAX,收集不保留的流份;
从而实现对SUMO化修饰肽段的二次富集。
2.按照权利要求1所述富集方法,其特征在于:
所述步骤2)的采用阴离子交换色谱SAX预富集多肽中保留的SUMO化肽段,具体步骤如下:
将所得的样品A采用A相溶解并上样到阴离子交换色谱柱上进行分离,先用含盐的摩尔浓度≤100 mM的流动相洗脱除去保留较弱的酶解肽段,然后采用含盐的摩尔浓度150 mM的流动相洗脱并收集保留较强的肽段流出液,将溶液除盐,冻干,得到样品B;
流动相按体积百分浓度计, A相:5-30%有机溶剂+1-50 mM碱的水溶液;B相: 5%-30%有机溶剂+1-50 mM 碱的水溶液+ 200-1000 mM 盐;
所述的有机溶剂包括乙腈、醇类、二甲基亚砜、N,N-二甲基甲酰胺、醚类、丙酮、吡啶、氯仿中的一种或二种以上;
所述的碱的水溶液为pH为8-14的碳酸氢铵缓冲盐溶液、pH为8-14的磷酸缓冲盐溶液、pH为8-14的三羟甲基氨基甲烷缓冲盐溶液、氨水、碳酸钠溶液、或氢氧化钠溶液中的一种或二种以上配置而成;
所述的盐包括阳离子为钾、钠中的一种或二种以上的卤素盐、磷酸盐、硝酸盐、羧酸盐、碳酸盐、硫酸盐中的一种或二种以上;
所述步骤3)的对收集到的SUMO化肽段用去SUMO化酶进行去SUMO化,具体步骤如下:
将所得的样品B溶于pH为4-10的缓冲液,加入去SUMO化酶进行去SUMO化反应,去SUMO化酶用量为肽段的100/1-1/100,酶解时间为2-72 h,酶解温度16-56 ℃,得到溶液C;
所述步骤4)的将样品再一次经过阴离子交换色谱SAX,收集不保留的流份,具体步骤如下:
将所得的溶液C上样到阴离子交换色谱柱,用步骤(2)的A相洗脱,收集存在于A相洗脱流出液中的不保留的酶解肽段,即为富集后的去SUMO化修饰的底物肽段。
3.按照权利要求2 所述的方法,其特征在于:
所述的pH为6-10缓冲液包括磷酸二氢钠、碳酸氢钠、4-羟乙基哌嗪乙磺酸、三乙二胺碳酸盐、2-(N-吗啡啉)乙磺酸、磷酸氢二钠中的一种或二种以上配置而成;缓冲液浓度为10-500 mM;
氨基活性试剂的醛类为甲醛、乙醛中的一种或二种以上,酸酐类为乙酸酐、丙酸酐中的一种或二种以上,卤化物为碘乙酰胺、氯乙酰胺中的一种或二种以上,胍基化试剂为O-甲基异脲、1-H-吡唑甲脒盐酸盐中的一种或二种以上,琥珀酰化试剂为琥珀酰亚胺酯类中的一种或二种以上;
当采用醛类试剂时,另外加入终浓度为10-600 mM的氰基硼氢化钠。
4.按照权利要求2所述的方法,其特征在于:
步骤3)所述的去SUMO化酶为SENP1、SENP2、SENP3、SENP5、SENP6、SENP7、SENP8中的一种或二种以上。
5.按照权利要求1所述的方法在生物样品中SUMO化修饰蛋白以及肽段的富集和鉴定中的应用;生物样品为人或动物或植物的细胞、组织、体液中的一种或二种以上。
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