[发明专利]一种可检测SNP的新型CPA方法、引物组和试剂盒在审
申请号: | 201911236426.6 | 申请日: | 2019-12-05 |
公开(公告)号: | CN110878367A | 公开(公告)日: | 2020-03-13 |
发明(设计)人: | 张建民;温俊平;廖明;张红霞 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6858;C12Q1/10;C12N15/11;C12R1/42 |
代理公司: | 佛山市禾才知识产权代理有限公司 44379 | 代理人: | 资凯亮;刘颖 |
地址: | 510000*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 snp 新型 cpa 方法 引物 试剂盒 | ||
1.一种可检测SNP的新型CPA方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取DNA为待检测模板;
(2)设计交叉引物组,所述交叉引物上设计与该DNA突变位点相结合的RNA碱基;
(3)建立反应体系,所述反应体系中包含RnaseHⅡ酶,将待检测模板加入到反应体系中进行扩增,当交叉引物与DNA突变位点相结合时,激活RnaseHⅡ酶发生切割,使扩增反应继续进行,当交叉引物与DNA突变位点不能结合时,扩增反应无法进行;
(4)判断反应物中是否具有目标DNA。
2.根据权利要求1所述的可检测SNP的新型CPA方法,其特征在于,所述步骤(4)中,以显色法检测反应物中是否具有目标DNA。
3.根据权利要求1所述的可检测SNP的新型CPA方法,其特征在于,所述交叉引物组包括引物:LoopB、B3、F3、B2和BIP。
4.根据权利要求1所述的可检测SNP的新型CPA方法,其特征在于,所述反应体系包括缓冲液、硫酸镁、dNTP、Bst酶、RnaseHⅡ酶、LoopB、B3、F3、B2和BIP。
5.根据权利要求1所述的可检测SNP的新型CPA方法,其特征在于,所述反应体系的反应温度为61℃。
6.基于权利要求1所述的可检测SNP的新型CPA方法的用于检测鸡白痢沙门菌的引物组,其特征在于,包括:
LoopB:5′-GCAATATTCTTATGCCTATCAGAGT-3′;
B3:5′-GGCAGTGATGTTCCACAAT-3′;
F3:5′-ACTATTGCTTGCTATGGAAGAC-3′;
B2:5′-TAACGAACCTGCAACAGCTTTAAT-3′;
BIP:
5′-TGCAACAGCTTTAATACTGCATCAAGTGATGAGATAGAC(RNA碱基)TCTAC-C3 spacer-3′;
所述引物组针对鸡白痢沙门菌rfbs基因。
7.基于权利要求1所述的可检测SNP的新型CPA方法的检测鸡白痢沙门菌的试剂盒,其特征在于,包括反应液,所述反应液包括LoopB、B3、F3、B2和BIP;
LoopB:5′-GCAATATTCTTATGCCTATCAGAGT-3′;
B3:5′-GGCAGTGATGTTCCACAAT-3′;
F3:5′-ACTATTGCTTGCTATGGAAGAC-3′;
B2:5′-TAACGAACCTGCAACAGCTTTAAT-3′;
BIP:
5′-TGCAACAGCTTTAAT-ACTGCATCAAGTGATGAGATAGAC(RNA碱基)TCTAC-C3 spacer-3′;
所述引物组针对鸡白痢沙门菌rfbs基因。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述反应液包括缓冲液2.5μl、硫酸镁2.0μl、dNTP 2μl、Bst酶1.0μl、RnaseHⅡ酶0.1μl、LoopB+B2 1μl、B3+F3 0.5μl和BIP 3μl。
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