[发明专利]一种检测DNA跨损伤合成修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒

权利要求书

1. 一种用于检测DNA跨损伤合成修复通路有效性的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒包括针对与DNA跨损伤合成修复通路相关基因的如SEQ ID NO.1～138所示探针组成的探针库。

2.根据权利要求1所述的一种用于检测DNA跨损伤合成修复通路有效性的试剂盒，其特征在于，与DNA跨损伤合成修复通路相关的基因包括POLB、POLM、UBE2A、PCNA、HLTF、MAD2L2、POLH、POLI、POLK、POLN、POLQ、RAD18、REV1、REV3L、SHPRH、UBE2B、UBE2N、UBE2V2、USP1、WDR48。

3. 根据权利要求1所述的一种用于检测DNA跨损伤合成修复通路有效性的试剂盒，其特征在于，所述基因POLB对应的探针序列如SEQ ID NO.1～3所示，所述基因POLM对应的探针序列如SEQ ID NO.4～8所示，所述基因UBE2A对应的探针序列如SEQ ID NO.9～12所示，所述基因PCNA对应的探针序列如SEQ ID NO.13～16所示，所述基因HLTF对应的探针序列如SEQ ID NO.17～26所示，所述基因MAD2L2对应的探针序列如SEQ ID NO.27～30所示，所述基因POLH对应的探针序列如SEQ ID NO.31～35所示，所述基因POLI对应的探针序列如SEQID NO.36～41所示，所述基因POLK对应的探针序列如SEQ ID NO.44～47所示，所述基因POLN对应的探针序列如SEQ ID NO.48～53所示，所述基因POLQ对应的探针序列如SEQ IDNO.54～71所示，所述基因RAD18对应的探针序列如SEQ ID NO.72～74所示，所述基因REV1对应的探针序列如SEQ ID NO. 75～85所示，所述基因REV3L对应的探针序列如SEQ ID NO.86～104所示，所述基因SHPRH对应的探针序列如SEQ ID NO. 105～117所示，所述基因UBE2B对应的探针序列如SEQ ID NO. 118～121所示，所述基因UBE2N对应的探针序列如SEQID NO. 122～123所示，所述基因UBE2V2对应的探针序列如SEQ ID NO. 124～126所示，所述基因USP1对应的探针序列如SEQ ID NO. 127～130所示，所述基因WDR48对应的探针序列如SEQ ID NO. 131～138所示。

4.一种检测与DNA跨损伤合成修复通路相关的基因的方法，其特征在于，包括以下步骤：

（1）获得受试者的DNA样本库；

（2）将权利要求1所述的试剂盒中SEQ ID NO.1～138所示的全部探针与所述DNA样本库进行杂交；

（3）分离步骤（2）的杂交产物，并释放出与试剂盒中探针杂交的基因片段，采用测序技术对分离出的基因片段进行测序从而检测基因的突变情况。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤（1）中的DNA样本库由双链DNA片段组成；

所述步骤（1）包括以下步骤：提取全基因组DNA，然后将其片段化；或者提取mRNA，将其片段化，然后以该经片段化的mRNA为模板合成双链cDNA。

6.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤（2）中的探针进行选择性标记。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述步骤（2）中的探针进行生物素标记。