[发明专利]一种检测DNA跨损伤合成修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒

说明书

本发明提供了一种检测DNA跨损伤合成修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒，所述探针库由SEQ ID NO.1～138所示探针组成，将该探针库制备成检测试剂盒可用于与DNA跨损伤合成修复通路相关的基因的检测。使用该探针库对待分析的目标DNA片段进行富集，然后再对富集后的DNA片段通过测序手段进行测序，从而实现对基因检测的有效性。与DNA跨损伤合成修复通路相关的基因可用于预测肿瘤发生的倾向性、评估肿瘤恶性程度和临床预后、指导新药筛选与研发，因此，本发明对基因功能性的研究方向起到重要的指导意义。

技术领域

本发明属于基因检测技术领域，具体涉及一种检测DNA跨损伤合成修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒。

背景技术

异常的DNA损伤修复通路与肿瘤发生倾向性及诱导DNA损伤类抗肿瘤药物对细胞的敏感性关系密切。DNA跨损伤合成修复通路是DNA修复机制中最重要的途径之一。修复过程简单来说，当DNA在复制过程中遇到损伤而停滞时，DNA聚合酶与解旋酶分离并在损伤处产生DNA单链，RPA将DNA单链封闭起来。接着，泛素化连接酶Rad6及Rad18对PCNA进行单泛素化修饰，低保真的DNA聚合酶（无校对功能）将高保真聚合酶替换掉，并在损伤DNA链互补链进行核苷酸插入，继续进行DNA复制延伸。DNA跨损伤合成修复通路在插入核苷酸时不依赖碱基互补配对原则，因此修复途径具有较高的差错可能和致突变倾向。严格来说，DNA跨损伤合成修复通路是一种DNA损伤的容忍机制，而非典型的DNA修复机制。

合成致死（Synthetic Lethality）的策略近年来在肿瘤的研究中得到广泛应用。合成致死在肿瘤研究中的概念为：当将两个不在同一修复通路中的重要基因的功能抑制掉其中之一时，细胞不会致死，但是将这两个基因的功能都抑制掉后，细胞死亡。在临床上，如果肿瘤细胞中存在其中之一的突变，而正常细胞中该基因正常，我们可以将另外一个基因作为靶点，并将其功能抑制住，达到特异性杀死肿瘤细胞，个体化治疗的目的。

前期研究发现，DNA跨损伤合成修复通路参与的基因发生胚系遗传突变、特异组织中体细胞突变与肿瘤的发生、治疗效果高度相关。其中，PolH及PolQ基因的多态性变异与多种肿瘤的发生高度相关；另外，通路参与基因的突变与肿瘤化疗的敏感性高度相关。这些基因的突变导致DNA跨损伤合成修复通路有效性的改变（减弱或缺失），对肿瘤的发生、预后、治疗策略的制定都具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种检测DNA跨损伤合成修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒。

为了实现上述目的，本发明提供以下技术方案：

一种用于检测DNA跨损伤合成修复通路有效性的试剂盒，所述的试剂盒包括针对与DNA跨损伤合成修复通路相关基因的如SEQ ID NO.1～138所示探针组成的探针库。

进一步的，与DNA跨损伤合成修复通路相关的基因包括POLB、POLM、UBE2A、PCNA、HLTF、MAD2L2、POLH、POLI、POLK、POLN、POLQ、RAD18、REV1、REV3L、SHPRH、UBE2B、UBE2N、UBE2V2、USP1、WDR48。