[发明专利]与芋肉纤维颜色紧密连锁的分子标记及其在芋育种中的应用

说明书

本发明公开了与芋肉纤维颜色紧密连锁的分子标记及其在芋育种中的应用。本发明利用SLAF‑seq技术获取与芋纤维颜色性状紧密关联的多态性SLAF标签，进一步筛选得到SEQ ID NO.1所示的分子标记Marker44764，应用该分子标记作为检测靶标能够将紫色与黄色的芋肉纤维材料进行准确区分，可在苗期对芋实生苗中的芋肉纤维颜色性状进行分子标记辅助选择。本发明进一步提供了扩增所述分子标记的检测引物以及用于芋肉纤维颜色性状的PCR检测试剂盒。本发明所提供的分子标记及检测引物克服了芋常规育种的不足，简化了选择方法并加快了芋育种的进程，有效提高了育种效率。

技术领域

本发明涉及植物品质性状的分子标记，尤其涉及与芋肉纤维颜色紧密连锁的分子标记及其在芋杂交育种中的应用，属于芋肉纤维颜色紧密连锁的分子标记领域。

背景技术

芋(Colocasia esculenta)为天南星科芋属多年生植物，其中槟榔芋属于魁芋的一种，因芋肉纤维颜色呈紫色槟榔花纹而得名，在中国广西、广东、福建、湖南等地均有栽培。目前生产上槟榔芋一般采用地方品种，品种结构较单一，近年来，相关单位已陆续开展芋开花诱导和杂交育种工作，通过有性杂交选育优质、抗病、高产的芋新品种是最有效的解决途径。

芋肉纤维颜色是芋球茎重要的品质性状，分为白色、黄色、棕色、紫色；其中，芋肉纤维呈紫色最受市场欢迎。芋肉纤维中含有10种黄酮类物质，具消炎、保护神经等作用。由于芋肉纤维颜色易识别，且能稳定遗传，常在芋遗传育种中作为理想的形态标记，但需要在芋成熟收获后才能进行鉴定，耗时费力。目前还无芋纤维颜色性状相关基因定位的报道。

随着分子生物学技术的飞速发展，分子育种技术大大加快了育种的进程，显著缩短了抗病品种选育的周期。SLAF-seq(specific length amplified fragmentsequencing)是指利用限制性内切酶打断基因组DNA，对特定片段进行高通量测序获得海量遗传多态性标签序列来充分代表目标物种全基因组信息的测序策略，具步骤简单、成本低、高通量的优点，已广泛应用于分子标记开发和遗传图谱构建。

通过SLAF-seq等技术获取与芋肉纤维颜色性状相关的分子标记，能够在苗期对芋育种材料中的芋肉纤维颜色性状进行分子标记辅助选择，可有效的克服常规育种的不足，简化选择方法和提高育种效率，加快芋杂交育种的进程。

发明内容

本发明的目的之一是提供一种与芋肉纤维颜色紧密连锁的分子标记；

本发明的目的之二是提供扩增所述分子标记的引物；

本发明的目的之三是将所述的分子标记或引物应用于芋杂交育种的辅助选择。

本发明的上述目的是通过以下技术方案来实现的：

与芋肉纤维颜色紧密连锁的分子标记Marker44764，所述的分子标记Marker44764的多核苷酸序列选自(1)-(3)中的任何一种：

(1)SEQ ID NO.1所示的多核苷酸序列；或

(2)与SEQ ID NO.1的互补序列在严谨杂交条件能够进行杂交的多核苷酸序列；或

(3)与SEQ ID NO.1的多核苷酸序列至少有80％以上同一性的多核苷酸序列；优选的，与SEQ ID NO.1的多核苷酸序列至少有85％以上同一性的多核苷酸序列；更优选的，与SEQ ID NO.1的多核苷酸序列至少有90％以上同一性的多核苷酸序列。

本发明进一步提供了扩增所述分子标记Marker44764的检测引物。

作为一种优选的实施方案，所述检测引物由SEQ ID NO.2所示和SEQ ID NO.3所示的两条多核苷酸序列组成。