[发明专利]一个影响山羊早期体重的分子标记及其引物和应用

说明书

本发明公开了一个影响山羊早期体重的分子标记及其引物和应用。一个影响山羊早期体重的分子标记，位于山羊PLAG1基因NC_030821.1:g.58751553位点，且具有A/T多态性，AA型山羊初生体重和3月龄体重高于AT型和TT型山羊。一种筛选早期快速生长山羊品种(系)的方法，包括检测山羊PLAG1基因NC_030821.1:g.58751553位点的A/T多态性，选择AA型个体留种。该多态位点可用于山羊生长性状的早期辅助选择，提高选择的准确性，加快育种进程。

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及一个影响山羊早期体重的分子标记及其引物和应用。

背景技术

PLAG1是多形性腺瘤基因家族成员之一，属于锌指转录因子。最早发现其在多形性腺瘤中高表达，促进多形性腺瘤的发生，后来陆续发现能促进脂肪母细胞瘤、肝母细胞瘤等多种肿瘤的发生。高表达的PLAG1与IGF2 P3启动子结合，上调IGF2的表达，促进细胞的增殖与抗凋亡(Voz ML et al，2000)，而IGF2是胎儿正常生长所必须的(Kadakia R et al，2016)。

Hensen K等(2004)研究表明，PLAG1基因敲除的小鼠胎儿生长发育阻滞，且影响到出生后生长。11.5天的基因敲除纯合子胚胎较同窝正常对照组轻18％，初生重较正常小鼠轻30％，此外，基因敲除纯合子胚胎出生后生长速度慢，到21日龄时，其体重仅为同窝对照组的一半。虽然断奶后有一快速追赶期，但60日龄时仍只有对照组体重的70％。说明PLAG1基因对小鼠体重具有重要的调节作用。

Abi Habib W等(2018)发现PLAG1基因突变可导致RSS综合征——一种胎儿生长发育阻滞的人类遗传病。PLAG1第5外显子439、1363位胞嘧啶缺失导致移码突变，分别产生截短的227、469个氨基酸的肽，可导致胎儿出生体重和身高的下降。

全基因组关联分析发现，牛PLAG1基因邻近区域存在与腿肌重显著相关的数量性状位点(Song Y et al，2016)。PLAG1-NCAPG基因间隔区一个数量性状位点与日本和牛阉牛日增重、体长、胴体性状连锁(Hoshiba H et al，2013)。QTL、eQTL分析发现，PLAG1启动子区变异、PLAG1表达水平与牛生长、产奶性状(乳脂、乳蛋白、产奶量)相关(Fink T et al，2017)。PLAG1 SNPs影响牛早期体重、青春期体重和生长(Littlejohn M et al，2012)。PLAG1 SNPs影响韩牛的胴体性状(Kim HJ et al，2017)。PLAG1存在与牛体尺相关的SNPs(Xu W et al，2018；Zhong JL et al，2018)。进化分析表明，现代牛体长的恢复主要受到PLAG1单倍型(Q)选择的影响(Utsunomiya YT et al，2017)。

选择性清扫分析发现猪的脊椎数与PLAG1相关(Rubin CJ et al，2012；Zhang Yet al，2018)。全基因组关联分析表明PLAG1是影响猪平均背脂厚、肢骨长的候选基因(QiaoR et al，2015；Guo Y et al，2015)。

虽然目前已经发现牛、猪PLAG1基因多态性与生长性状相关，但山羊PLAG1基因多态性及其与生长性状的相关性均未见报道。

发明内容

本发明的目的在于克服山羊育种中生长性状表型选择准确性低，遗传进展慢的缺陷，提供一个影响山羊早期体重的分子标记。

本发明的另一目的是提供该分子标记的应用。

本发明的又一目的是提供一种筛选快速生长的山羊品种(系)的方法。

本发明的目的可通过如下技术方案实现：

一个影响山羊早期体重的分子标记，所述分子标记为克隆自山羊PLAG1基因3’UTR区NC_030821.1:g.58751553位点的一段核苷酸序列，该位点具有A/T多态性，AA型山羊早期体重高于AT型和TT型山羊。