[发明专利]一种与猪初生重性状相关的SNP标记及应用有效
申请号: | 201911277000.5 | 申请日: | 2019-12-12 |
公开(公告)号: | CN112980962B | 公开(公告)日: | 2022-05-31 |
发明(设计)人: | 王然;杨漫漫;魏强 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院;深圳市华大农业应用研究院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 李小焦;彭家恩 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 初生 性状 相关 snp 标记 应用 | ||
1.一种与猪初生体重性状相关的SNP标记,其特征在于:所述SNP标记位于猪国际基因组11.1版本参考序列的第4号染色体上第112031589位核苷酸位点,所述SNP标记在所述位点处为G或A。
2.根据权利要求1所述的SNP标记,其特征在于:所述SNP标记位于SEQ ID No.1所示序列自5’端起的第127位碱基。
3.根据权利要求1或2所述的SNP标记,其特征在于:所述SNP标记为AA基因型的母猪所产仔猪的初生体重显著大于所述SNP标记为AG基因型或GG基因型的母猪所产仔猪的初生体重。
4.一种检测权利要求1-3任一项所述的SNP标记的引物对,其特征在于:所述引物对的上游引物为Seq ID No.2所示序列,下游引物为Seq ID No.3所示序列。
5.一种检测权利要求1-3任一项所述的SNP标记的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中包括权利要求4所述的引物对。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括用于PCR扩增的试剂。
7.一种检测权利要求1-3任一项所述的SNP标记的方法,其特征在于:包括采用权利要求4所述的引物对,或者权利要求5或6所述的试剂盒,对待测母猪的基因组DNA进行PCR扩增,通过对PCR扩增产物序列的测定,获得所述SNP标记的碱基情况。
8.一种预测仔猪的初生体重的方法,其特征在于:采用权利要求4所述的引物对,或者权利要求5或6所述的试剂盒,对母猪的基因组DNA进行PCR扩增,通过对PCR扩增产物序列的测定,获得权利要求1-3任一项所述的SNP标记的碱基情况,根据所述SNP标记的碱基情况预测母猪所产仔猪的初生体重;所述SNP标记为AA基因型的母猪所产仔猪的初生体重显著大于所述SNP标记为AG基因型或GG基因型的母猪所产仔猪的初生体重。
9.根据权利要求4所述的引物对或权利要求5或6所述的试剂盒在猪初生体重预测或在提高猪初生体重的分子标记辅助育种中的应用,其中,SNP标记为AA基因型的母猪所产仔猪的初生体重显著大于SNP标记为AG基因型或GG基因型的母猪所产仔猪的初生体重,所述SNP标记位于猪国际基因组11.1版本参考序列的第4号染色体上第112031589位核苷酸位点,所述SNP标记在所述位点处为G或A。
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