[发明专利]一种与猪初生重性状相关的SNP标记及应用

说明书

本申请公开了一种与猪初生重性状相关的SNP标记及应用。本申请与猪初生重性状相关的SNP标记，位于猪国际基因组11.1版本参考序列的第4号染色体上第112031589核苷酸位点，具有G或A多态性。本申请与猪初生重性状相关的SNP标记，可以用于仔猪的初生重量预测和猪的分子标记辅助选择选育。采用本申请的SNP标记进行育种，不仅可缩短育种时间，提高选育准确性；而且不易受其他外界环境等因素影响；能够更有效的提高仔猪的初生重量，从而提高成活率、断奶重和育肥效果，对猪的养殖生产具有重大意义。采用本申请的SNP标记进行辅助育种，可进行早期选育，及时淘汰，减少育种成本，快速获得纯合亲本，提高育种效率和质量。

技术领域

本申请涉及猪育种技术领域，特别是涉及一种与猪初生重性状相关的SNP标记及应用。

背景技术

猪肉含有丰富的蛋白质、维生素和矿物质，是我国居民日常生活中主要的副食品。虽然我国的人口增长速度在减缓，但人口数量仍然处于持续增长的状态，对猪肉的需求也将保持增长状态。所以养殖产业需要提高优质猪肉的供给能力。

仔猪出生时的体重即猪初生重，是衡量猪的一个重要数量性状，影响猪一生的生长发育、生产性能和胴体等级等。猪初生重与猪肉的出栏重呈正相关，与出栏日龄呈负相关。据报道，初生重低于1.0kg的仔猪，大多生长发育不良，初生重1.5kg以上则发育明显较好。研究表明，仔猪初生重与断奶成活率、断奶重、出栏重之间都具有积极的正相关性；仔猪初生重每增加0.1kg，断奶重将提高1kg，出栏重将提高10kg。因此有针对性的对提高仔猪初生重，可使得仔猪有更高的成活率和更优良的生产性能，进而为生产者带来更大的经济效益。

仔猪初生重是一个复杂的数量性状，由多基因共同调控，且受到品种、胎次、营养及环境等诸多因素的影响。传统的育种方法多采用传统表型选育技术，即根据后代表型信息推断亲本生产力，选育周期长，遗传进展缓慢。采用分子标记辅助选择(maker assistedselection，MAS)进行选育，其优势在于不易受其他外界环境等因素的影响，可缩短育种时间，提高选育的准确性。利用MAS技术改良种猪的初生重性状，仔猪的初生重越大，成活率越高、断奶重越大、育肥效果越好，对养殖生产中经济效益的提升具有重大意义。

因此，亟需对影响猪初生重的基因和分子标记进行深入的研究和挖掘，以满足猪的分子标记辅助选择育种需求。

发明内容

本申请的目的是提供一种新的与猪初生重性状相关的SNP标记及应用。

本申请具体采用了以下技术方案：

本申请的第一方面公开了一种与猪初生重性状相关的SNP标记，该SNP标记位于猪国际基因组11.1版本参考序列的第4号染色体上第112031589核苷酸位点，具有G或A多态性。

需要说明的是，本申请通过对674头母猪的139634个SNP标记进行研究，最终得出母猪的第4号染色体上第112031589核苷酸位点与其所产仔猪的猪初生重性状直接相关。研究显示，该SNP位点的多态性为G或A，并且，AA基因型的母猪所产仔猪的猪初生重显著大于AG基因型或GG基因型的母猪。

优选的，本申请的SNP标记位于SEQ ID No.1所示序列自5’端起的第127位碱基。

需要说明的是，SEQ ID No.1所示序列的第127位碱基，只是为了更简单、明了的展示出本申请的SNP标记。SEQ ID No.1所示序列只是本申请的一种实现方式中，具体设计的SNP标记检测引物的扩增序列；可以理解，如果采用不同的检测引物，本申请SNP标记的位置可能不是在第127位碱基；但是，如果按照猪国际基因组11.1版本参考序列，本申请的SNP标记的准确位置即第4号染色体上第112031589核苷酸位点。

优选的，本申请的SNP标记为AA基因型的母猪所产仔猪的猪初生重显著大于AG基因型或GG基因型的母猪。