[发明专利]特发性肺纤维化疾病诊断标志物及其制备诊断或预后工具中的应用在审
申请号: | 201911277110.1 | 申请日: | 2019-12-12 |
公开(公告)号: | CN110923308A | 公开(公告)日: | 2020-03-27 |
发明(设计)人: | 王兰;余国营 | 申请(专利权)人: | 河南师范大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;G01N33/68;G01N33/543;C07K14/47;C12N15/12 |
代理公司: | 新乡市平原智汇知识产权代理事务所(普通合伙) 41139 | 代理人: | 路宽 |
地址: | 453007 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 特发性肺 纤维化 疾病诊断 标志 及其 制备 诊断 预后 工具 中的 应用 | ||
1.特发性肺纤维化疾病诊断标志物,其特征在于该诊断标志物为COX5B基因表达产物,COX5B基因的编码序列包括以下任一一种DNA序列:
(1)序列表中SEQ ID NO.2所示的DNA序列;
(2)在严格条件下与(1)限定的DNA序列杂交且编码相同功能蛋白质的DNA序列;
(3)与(1)或(2)限定的DNA序列具有70%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列。
2.根据权利要求1所述的特发性肺纤维化疾病诊断标志物,其特征在于:所述COX5B基因表达产物包括COX5B蛋白、COX5B蛋白的功能等同物以及COX5B蛋白的部分肽,其中COX5B蛋白的部分肽含有与特发性肺纤维化相关的功能域;COX5B蛋白的功能等同物包括COX5B蛋白保守性变异蛋白质,或其活性片段,或其活性衍生物,等位变异体、天然突变体、诱导突变体、在高或低的严紧条件下能与COX5B的DNA杂交的DNA所编码的蛋白质。
3.根据权利要求2所述的特发性肺纤维化疾病诊断标志物,其特征在于:所述COX5B蛋白是具有下列氨基酸序列的蛋白质:
(1)由序列表中SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(2)将SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列具有相同功能的由SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列衍生的蛋白质,取代、缺失或者添加的氨基酸的个数通常为1-50个;
(3)与SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列具有至少80%同源性的氨基酸序列构成的多肽,又称为序列同一性的多肽。
4.根据权利要求1所述的特发性肺纤维化疾病诊断标志物,其特征在于:所述COX5B基因及其表达产物的来源包括但不限于血液、组织液、尿液、唾液、肺组织、支气管肺泡灌洗样本或呼出气冷凝液或脊髓液。
5.权利要求1-4中任意一项所述的特发性肺纤维化疾病诊断标志物在制备诊断或预后工具中的应用,其特征在于:通过RT-PCR、实时定量PCR、免疫检测、原位杂交、芯片或高通量测序平台检测COX5B基因的表达水平以诊断特发性肺纤维化疾病,在IPF患者血清中COX5B基因的表达水平较高,说明IPF患者线粒体损伤严重,COX5B基因的表达产物释放到血清中,并且COX5B基因的表达水平与IPF患者生存OS负相关,生存差的IPF患者血清中COX5B基因的表达水平较高。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:用RT-PCR诊断特发性肺纤维化的产品至少包括一对特异扩增COX5B基因的引物;用实时定量PCR诊断特发性肺纤维化的产品至少包括一对特异扩增COX5B基因的引物;用免疫检测诊断特发性肺纤维化的产品包括与COX5B基因表达产物特异性结合的抗体;用原位杂交诊断特发性肺纤维化的产品包括与COX5B基因的核酸序列杂交的探针;用芯片诊断特发性肺纤维化的产品包括蛋白芯片和基因芯片;其中蛋白芯片包括与COX5B蛋白特异性结合的抗体,基因芯片包括与COX5B基因的核酸序列杂交的探针。
7.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:用实时定量PCR诊断特发性肺纤维化的产品至少包括一对特异扩增COX5B基因的引物,该引物序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10及SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示。
8.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:所述工具通过检测样本中COX5B基因的表达来诊断特发性肺纤维化,该工具包括芯片、试剂盒、试纸或高通量测序平台。
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