[发明专利]外周血甲基化基因及IDH1联合检测诊断肺癌模型

权利要求书

1.甲基化SHOX2基因、甲基化PTGER4基因和IDH1蛋白组合作为标志物在制备用于诊断或者辅助诊断肺癌的产品中的应用；

在所述应用中，按照如下诊断或者辅助诊断肺癌：检测待测者的SHOX2基因甲基化水平、PTGER4基因甲基化水平和外周血中IDH1蛋白的含量；然后将检测值代入联合检测诊断预测模型，计算诊断模型预测值，当诊断模型预测值≤0.569时，则认为所述待测者不为或候选不为肺癌患者；当模型预测值＞0.569时，则认为所述待测者为或候选为肺癌患者；

所述联合检测诊断预测模型如以下公式所示；

诊断模型预测值= 16.821+0.435×IDH1-0.147×SHOX2-0.28×PTGER4；

式中，IDH1表示所述待测者的外周血中IDH1蛋白的浓度；SHOX2表示所述待测者的SHOX2基因的甲基化水平；PTGER4表示所述待测者的PTGER4基因的甲基化水平。

2.用于检测SHOX2基因甲基化水平的物质、用于检测PTGER4基因甲基化水平的物质和用于检测IDH1蛋白含量的物质和记载有诊断方法的可读性载体在制备用于诊断或者辅助诊断肺癌的产品中的应用；

所述诊断方法为：检测待测者的SHOX2基因甲基化水平、PTGER4基因甲基化水平和外周血中IDH1蛋白的含量；然后将检测值代入联合检测诊断预测模型，计算诊断模型预测值，当诊断模型预测值≤0.569时，则认为所述待测者不为或候选不为肺癌患者；当模型预测值＞0.569时，则认为所述待测者为或候选为肺癌患者；

所述联合检测诊断预测模型如以下公式所示；

诊断模型预测值= 16.821+0.435×IDH1-0.147×SHOX2-0.28×PTGER4；

式中，IDH1表示所述待测者的外周血中IDH1蛋白的浓度；SHOX2表示所述待测者的SHOX2基因的甲基化水平；PTGER4表示所述待测者的PTGER4基因的甲基化水平。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：所述待测者的SHOX2基因的甲基化水平的高低以对所述待测者的SHOX2基因进行甲基化特异性Real-time PCR反应时的Ct值体现；所述待测者的PTGER4基因的甲基化水平的高低以对所述待测者的PTGER4基因进行甲基化特异性Real-time PCR反应时的Ct值体现。

4.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：所述诊断或者辅助诊断肺癌为诊断或者辅助诊断人类肺癌。

5.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：所述肺癌为肺腺癌或非腺癌。

6.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：所述肺癌为T1-2期肺癌或T3-4期肺癌。

7.用于诊断或者辅助诊断肺癌的系统，包括：

1）用于检测SHOX2基因甲基化水平的试剂和/或仪器；

2）用于检测PTGER4基因甲基化水平的试剂和/或仪器；

3）用于检测IDH1蛋白的试剂和/或仪器；

4）装置，所述装置包括数据输入模块、数据运算模块、数据比较模块和结论输出模块；

所述数据输入模块用于输入1）-3）检测得到的待测者的SHOX2基因甲基化水平、PTGER4基因甲基化水平和外周血中IDH1蛋白含量的检测值；

所述数据运算模块用于将所述检测值代入联合检测诊断预测模型，计算诊断模型预测值；所述联合检测诊断预测模型如以下公式所示；诊断模型预测值=16.821+0.435×IDH1-0.147×SHOX2-0.28×PTGER4；式中，IDH1表示所述待测者的外周血中IDH1蛋白的浓度；SHOX2表示所述待测者的SHOX2基因的甲基化水平；PTGER4表示所述待测者的PTGER4基因的甲基化水平；

所述数据比较模块用于将所述诊断模型预测值与阈值进行比较；所述阈值为0.569；

所述结论输出模块用于输出结论，当所述诊断模型预测值≤0.569时，则输出“所述待测者不为或候选不为肺癌患者”的结论；当所述模型预测值＞0.569时，则输出“所述待测者为或候选为肺癌患者”的结论。