[发明专利]自动化报告解读方法及系统在审
申请号: | 201911328539.9 | 申请日: | 2019-12-20 |
公开(公告)号: | CN111161824A | 公开(公告)日: | 2020-05-15 |
发明(设计)人: | 梁萌萌;余伟师;谢欣 | 申请(专利权)人: | 苏州赛美科基因科技有限公司 |
主分类号: | G16H15/00 | 分类号: | G16H15/00;G16H50/70;G06F40/166;G06F40/186;G16B20/00;G16B30/00 |
代理公司: | 南京九致知识产权代理事务所(普通合伙) 32307 | 代理人: | 韩莲 |
地址: | 215131 江苏省苏州市相城区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 自动化 报告 解读 方法 系统 | ||
1.自动化报告解读方法,其特征在于,包括:
获取生信分析的各项证据数据源;
对各项证据数据源的分值进行计算,将计算结果中代表致病性的数值定义为值A,将计算结果中代表良性结果的数值定义为值B;
将生信分析的各个位点根据计算结果的分值按序排序;
根据行业金标准筛选致病性位点;
将致病性位点数据、患者表型数据、本地关系型数据库中的相关数据对应后导入模板;其中,相关数据包括基因功能数据、表型描述数据以及评级证据;
给模板中加入结论性描述,得到完整报告。
2.根据权利要求1所述的自动化报告解读方法,其特征在于,所述值A中A为数字;值B中B为数字;生信分析的各个位点根据计算结果的分值按数字大小排序。
3.根据权利要求1所述的自动化报告解读方法,其特征在于,还包括将完整报告生成JSON格式的报告数据,并将JSON格式的报告存储于历史报告数据库。
4.根据权利要求1所述的自动化报告解读方法,其特征在于,所述本地关系型数据库包括OMIM数据库、CHPO数据库、HGMD数据库以及历史报告数据库;所述本地关系型数据库中OMIM数据库、CHPO数据库、HGMD数据库以及历史报告数据库采用ER关系图模式,按基因—表型关系关联,并形成多维度数据体系。
5.根据权利要求1所述的自动化报告解读方法,其特征在于,还包括将完整报告生成JSON格式的报告数据与HTML文本进行合成,并成成PDF报告。
6.根据权利要求1所述的自动化报告解读方法,其特征在于,对各项证据数据源的分值进行计算采用的是加权平均计算。
7.根据权利要求1所述的自动化报告解读方法,其特征在于,对各项证据数据源的分值进行计算采用的逻辑回归算法。
8.一种自动化报告解读系统,其特征在于,包括
智能分析模块,用于获取生信分析的各项证据数据源文件,并将结果文件中的各项数据进行加权平均计算,并将计算结果中各位点按致病性高低排序;
报告撰写模块,用于获取智能分析模块的计算结果、患者表型数据以及本地关系数据库中的数据,并进行结论性描述文字;
生成模块,接收报告撰写模块报告的数据,并结合模板编辑模块中HTML文本合成,并生成PDF报告。
9.一种存储介质,其特征在于,所述存储介质中存储有计算机程序,其中,所述计算机程序被设置为运行时执行所述权利要求1至7任一项中所述的方法。
10.一种电子装置,包括存储器和处理器,其特征在于,所述存储器中存储有计算机程序,所述处理器被设置为运行所述计算机程序以执行所述权利要求1至7任一项中所述的方法。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于苏州赛美科基因科技有限公司,未经苏州赛美科基因科技有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201911328539.9/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。