[发明专利]构建侧翼已知序列的测序文库的引物组和方法在审

专利信息
申请号: 201911336316.7 申请日: 2019-12-23
公开(公告)号: CN113088561A 公开(公告)日: 2021-07-09
发明(设计)人: 聂自豪;杨林;张艳艳;陈芳;蒋慧 申请(专利权)人: 深圳华大智造科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06;C12N15/11
代理公司: 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 代理人: 肖阳
地址: 518083 广东省深圳*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 构建 侧翼 已知 序列 序文 引物 方法
【权利要求书】:

1.一种引物组,其特征在于,包括:第一组引物和第二组引物,

所述第一组引物包括第一引物和第二引物,沿5’端到3’端方向,所述第一引物包括第一特异性序列、第一间隔固定序列以及第一随机序列,所述第二引物包括第二特异性序列、第二间隔固定序列以及第二随机序列,所述第一特异性序列与双链DNA中第1链上5’端已知序列匹配,所述第二特异性序列与所述双链DNA中第2链上5’端已知序列匹配,所述第一间隔固定序列与所述双链DNA中第1链不匹配,所述第二间隔固定序列与所述双链DNA中第2链不匹配;

所述第二组引物包括第三引物和第四引物,所述第三引物的3’端为所述第一间隔固定序列,所述第四引物的3’端为所述第二间隔固定序列。

2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述第一间隔固定序列和第二间隔固定序列为接头序列;

所述第三引物和第四引物的5’端包括文库标签序列和文库标签测序引物结合序列。

3.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述已知序列的长度为18~30nt,所述第一间隔固定序列和第二间隔固定序列的长度分别为18~30nt,所述第一随机序列和第二随机序列的长度分别为6~15nt。

4.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中含有容器以及位于所述容器中的权利要求1~3任一项所述的引物组。

5.一种构建侧翼已知序列的测序文库的方法,其特征在于,包括:

利用第一组引物对侧翼已知序列进行第一轮PCR扩增,以便得到第一扩增产物;

利用第二组引物对所述第一扩增产物进行第二轮PCR扩增,以便得到侧翼已知序列测序文库,

其中,所述第一组引物与第二组引物是如权利要求1~3任一项所述引物组中所限定的。

6.一种测序文库,其特征在于,所述测序文库是利用权利要求5所述的方法制备的。

7.权利要求6所述测序文库的用途,其特征在于,用作高通量测序平台的文库。

8.根据权利要求7所述的用途,其特征在于,所述高通量测序平台选自MGI测序平台、Illumina测序平台或proton测序平台。

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