[发明专利]一种评估抗结核药物治疗所致肝损伤风险的诊断试剂盒在审
申请号: | 201911350221.0 | 申请日: | 2019-12-24 |
公开(公告)号: | CN110964804A | 公开(公告)日: | 2020-04-07 |
发明(设计)人: | 秦胜营;怀聪;贺林 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 上海段和段律师事务所 31334 | 代理人: | 陈少凌;郭国中 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 评估 结核 药物 治疗 所致 损伤 风险 诊断 试剂盒 | ||
1.一种与抗结核药物治疗所致肝损伤风险相关的分子标志物,其特征在于,所述标志物为位于NCX2基因上的CpG位点的甲基化水平,该CpG位点绝对位置为chr19:47447537-47447538(GRCh38)。
2.一种如权利要求1所述的分子标志物在制备检测抗结核治疗所致药物性肝损伤风险的试剂盒中的用途。
3.一种扩增分离的含如权利要求1所述的分子标志物中的CpG位点的核苷酸,其特征在于,所述核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述CpG位点位于SEQ ID NO:1所示序列的第24356-24357位。
4.一种如权利要求3所述的核苷酸在制备检测抗结核治疗所致药物性肝损伤风险的试剂盒中的用途。
5.一种针对chr19:47447537-47447538(GRCh38)CpG位点DNA甲基化水平进行检测的引物对,其特征在于,所述引物对:SEQ ID No:2、SEQ ID No:3所示。
6.一种检测抗结核治疗所致药物性肝损伤风险的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:根据如SEQ ID NO:1所示序列的第24356-24357位的上下游设计的引物对。
7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述引物对的序列如SEQ ID No:2、SEQ IDNo:3所示。
8.一种如权利要求6或7所述的试剂盒的非诊断目的使用方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
步骤一,提取样品DNA;
步骤二,将DNA进行亚硫酸氢盐处理和纯化;
步骤三,利用所述引物进行扩增,得扩增产物;
步骤四,检测所述扩增产物中chr19:47447537-47447538CpG位点的甲基化水平;甲基化水平在4%以下的认定为抗结核治疗所致药物性肝损伤风险高。
9.如权利要求8所述的使用方法,其特征是,步骤四中,所述检测的方法包括MassARRAY飞行质谱检测、焦磷酸测序、高分辨率溶解曲线分析技术、甲基化特异性PCR技术或变性高效液相色谱法。
10.如权利要求8所述的使用方法,其特征是,步骤三中,所述扩增的具体条件如下:反应体系为10μL,其中含有:
50mM KCl,10mM Tris-HCl(pH8.3),2mM MgCl2,200μM dNTPs,0.4U Taq DNA聚合酶,0.4μM SEQ ID No:2引物,0.4μM SEQ ID No:3引物,20-25ng经过亚硫酸氢盐处理的模板DNA,双蒸水补足至10μL;
PCR反应程序为:95℃ 4min;45×(95℃ 20s;56℃ 30s,72℃ 1min)72℃ 3min。
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