[发明专利]水稻耐高温性状的连锁KASP分子标记及其应用

权利要求书

1.水稻耐高温性状的连锁KASP分子标记，所述连锁KASP分子标记为7238、6400、7334；

所述分子标记7238为QTL区间qSSR7-1的连锁标记，所述分子标记6400、7334为QTL区间qSSR11-1的连锁标记；

所述分子标记7238为第7染色体29287238位碱基上的变异C/T，所述分子标记6400为第11染色体26796400位碱基上的变异A/C，所述分子标记7334为第11染色体26797334位碱基上的变异A/G。

2.用于扩增如权利要求1所述连锁KASP分子标记7238、6400、7334的引物，其特征在于，所述6400的连锁KASP分子标记的引物序列如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示；

所述7334的连锁KASP分子标记的引物序列如SEQ ID No.4、SEQ ID No.5和SEQ IDNo.6所示；

所述7238的连锁KASP分子标记的引物序列如SEQ ID No.7、SEQ ID No.8和SEQ IDNo.9所示。

3.一种用于改良水稻耐高温性的试剂盒，包含如权利要求2所述连锁KASP分子标记7238、6400、7334的引物。

4.如权利要求1所述连锁KASP分子标记、如权利要求2所述连锁KASP分子标记引物或如权利要求3所述试剂盒在筛选耐高温水稻品种中的应用。

5.如权利要求1所述连锁KASP分子标记、如权利要求2所述连锁KASP分子标记引物或如权利要求3所述试剂盒在水稻耐高温性改良育种中的应用。

6.利用如权利要求1所述分子标记的引物进行基因分型的方法，包括如下步骤：

以植物基因组DNA为模板，采用如权利要求2所述分子标记7238、6400和/或7334的引物进行PCR(聚合酶链式反应)，待反应完成后，将PCR扩增的产物借助荧光信号采集仪器，获取对应的产物荧光信号值，最终完成基因分型；

所述反应的体系包括20～30ng/L、DNA 2μL，所述分子标记7238、6400、7334的引物各0.28μL和2×KASP Master mixture；

所述反应的条件为：94℃15min；94℃20sec，63℃～55℃1min，每个循环降0.8℃，共10个循环；94℃20sec，56℃1min，共26个循环；

所述荧光信号值的读取条件为16℃，20sec；

所述的荧光信号采集仪器包括但不限于荧光定量PCR仪。

7.基于如权利要求1所述分子标记鉴定水稻品种耐高温QTL qSSR7-1、qSSR11-1基因型的方法，包括以下步骤：

(1)提取待鉴定水稻品种的DNA样本；

(2)以利用如权利要求1所述分子标记进行KASP检测；

(3)根据荧光信号结果，判断待检测水稻品种的qSSR7-1、qSSR11-1基因型：若只检测到6-羧基荧光素的荧光信号，则待测水稻品种为耐高温基因型；若只检测到六氯－6－甲基荧光素的荧光信号，则待测水稻品种为高温敏感基因型；若同时检测到两种荧光信号，则待测水稻品种为杂合基因型。