[发明专利]一种检测人线粒体ATP6基因8993位点基因型的试剂盒及方法在审
申请号: | 201911420591.7 | 申请日: | 2019-12-31 |
公开(公告)号: | CN111621556A | 公开(公告)日: | 2020-09-04 |
发明(设计)人: | 纪冬梅;宗凯;曹云霞;邹薇薇;李云飞;刘雅静;陈逸青;邓晓红;章志国;魏兆莲;周平;王喆;盛旋;余晓峰 | 申请(专利权)人: | 安徽医科大学第一附属医院;合肥海关技术中心 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 苏州翔远专利代理事务所(普通合伙) 32251 | 代理人: | 王华 |
地址: | 230000 安*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 线粒体 atp6 基因 8993 基因型 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测人线粒体ATP6基因8993位点基因型的试剂盒,其特征在于:包括用于扩增线粒体ATP6基因8993位点的PCR引物和Taqman-MGB探针;
所述PCR引物包括:上游引物F:5′-GTTATTATCGAAACCATCAGCCT-3′;
下游引物R:5′-AGTAGGTGGCCTGCAGTAATGT-3′;
所述探针包括:Taqman-MGB探针PT:5′VIC-CAATAGCCCGGGCC-MGB-3′;
Taqman-MGB探针PG:5′FAM-CAATAGCCCTGGCC-MGB-3′。
2.根据权利要求1所述的检测线粒体8993位点基因型的试剂盒,其特征在于:还包括PCR预混液,该PCR预混液中含有PCR缓冲液、Taq DNA聚合酶、MgCl2和dNTPs。
3.根据权利要求1所述的检测线粒体8993位点基因型的试剂盒,其特征在于:包含阳性对照品,该阳性对照品包括线粒体ATP6基因8993位点TT型质粒、线粒体ATP6基因8993位点GG型质粒。
4.一种检测线粒体8993位点基因型的方法,其特征在于:包括下列步骤:
步骤1:提取待测样品DNA;
步骤2:在PCR反应管中加入PCR预混液、引物、探针、无菌的超纯水和步骤1提取的模板DNA,得到反应体系;同时建立TT型对照管、GG型对照管、TG型对照管和空白对照管;所述TT型对照管中用线粒体ATP6基因8993位点TT型质粒替代步骤1提取的模板DNA;所述GG型对照管中用线粒体ATP6基因8993位点GG型质粒替代步骤1提取的模板DNA;所述TG型对照管中用线粒体ATP6基因8993位点TT型质粒和线粒体ATP6基因8993位点GG型质粒的混合物替代步骤1提取的模板DNA;所述空白对照管用无菌的超纯水替代步骤1提取的模板DNA;
所述PCR引物包括:上游引物F:5′-GTTATTATCGAAACCATCAGCCT-3′;
下游引物R:5′-AGTAGGTGGCCTGCAGTAATGT-3′;
所述探针包括:Taqman-MGB探针PT:5′VIC-CAATAGCCCGGGCC-MGB-3′;
Taqman-MGB探针PG:5′FAM-CAATAGCCCTGGCC-MGB-3′;
步骤3:将反应体系混合好后,进行荧光PCR扩增;
步骤4:根据FAM通道和HEX通道的扩增情况来进行结果判定,仅FAM通道有扩增S型曲线,判断该样品为TT型,仅VIC通道有扩增S型曲线,判断该样品为GG型,FAM和VIC通道均有S型曲线则判断为TG型。
5.根据权利要求4所述的检测线粒体8993位点基因型的方法,其特征在于:所述荧光PCR扩增条件:95℃/5min,95℃/15sec,60℃/1min,其中95℃/15sec至60℃/1min过程进行40个循环。
6.根据权利要求4所述的检测线粒体8993位点基因型的方法,其特征在于:所述PCR预混液,该PCR预混液中含有PCR缓冲液、Taq DNA聚合酶、MgCl2和dNTPs。
7.根据权利要求4所述的检测线粒体8993位点基因型的方法,其特征在于:线粒体ATP6基因8993位点TT型质粒和线粒体ATP6基因8993位点GG型质粒按照1:1的质量比例构成的混合物替代步骤1提取的模板DNA。
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