[发明专利]一种应用于双链DNA片段的纯化方法在审
申请号: | 201911420751.8 | 申请日: | 2019-12-31 |
公开(公告)号: | CN111073885A | 公开(公告)日: | 2020-04-28 |
发明(设计)人: | 李洋;张征立;李长征;王朋;康涛 | 申请(专利权)人: | 江苏耀海生物制药有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京中政联科专利代理事务所(普通合伙) 11489 | 代理人: | 秦佩 |
地址: | 225300 江苏省泰*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 应用于 dna 片段 纯化 方法 | ||
1.一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,该方法通过一步层析完成,所用原料及运作参数如下:
层析系统:AKTA Pure150;
层析柱尺寸:21.2*150mm;
流速:3~6mL/min;
流动相A-平衡缓冲液、流动相B-上样洗脱液;
平衡:至基线平稳;
上样:80mL酶切产物;
Wash:2~4个CV;
线性洗脱:28%-83%(流动相B)洗23~28CV。
2.根据权利要求1所述的一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,所述层析柱所用填料为GE SOURCE 30Q,应用过程中流速高,稳定性好,其活性基团R-O-CH2-CHOH-CH2-O-CH2-CHOH-CH2-N+(CH3)3可以有效结合带负电荷的基团,平均粒径较小为30μm,保障了良好的分辨率。
3.根据权利要求1所述的一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,所述基线平稳具体至紫外值固定变化在0.5-1mAu。
4.根据权利要求1所述的一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,所述平衡缓冲液:p H 6.5,50mM Tris-HCl,1mM EDTA;所述上样洗脱液:pH 6.5,50mM Tris-HCl,1mMEDTA,2M NaCl。
5.根据权利要求4所述的一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,所述缓冲液的pH值都较高,形成了比核酸等电点pH高的环境,使得核酸带净负电荷,可被填料吸附,不同长度的核酸,核酸带电量不同,吸附强度不一,依次解离纯化分离。
6.根据权利要求1所述的一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,所述酶切产物为分子量相差3000bp之内的双链线性DNA分子。
7.根据权利要求1所述的一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,所述酶切产物经过超滤浓缩无菌化处理,并以PVDF滤膜去除内毒素;所述层析为阴离子交换层析,吸附核酸于填料上,经过洗脱,得到目的片段。
8.根据权利要求1所述的一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,所述层析过程后进行误差线性曲线的绘制,包括如下步骤:
先用nanodrop2000测定该双链DNA片段浓度,然后用TEbuffer稀释至10μg/mL,20μg/mL,50μg/mL,200μg/mL,500μg/mL,1000μg/mL五个浓度梯度,量取峰面积做线性曲线,所用原料及试剂如下:
层析柱:TSKgel DNA-NPR色谱柱;
试剂:流动相A-平衡缓冲液(20mM Tris-HCl,pH9.0);
流动相B-洗脱缓冲液(20mM Tris-HCl,1M NaCl,pH9.0);
0-100%洗脱;
流速:1mL/min;
线性洗脱:0→55%B,22CV,55%-65%B,20CV。
9.根据权利要求7所述的一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,所述洗脱过程为通过核酸吸附强度的差异性,致使较小长度的核酸先脱落。
10.根据权利要求1所述的一种应用于双链DNA片段的纯化方法,其特征在于,所述Wash:4个CV;所述线性洗脱:32%-78%(流动相B)洗26CV。
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