[发明专利]带有电荷标签的核苷酸及其使用方法在审

专利信息
申请号: 201980003313.3 申请日: 2019-02-19
公开(公告)号: CN111164222A 公开(公告)日: 2020-05-15
发明(设计)人: J·曼德尔;S·格雷维纳;S·佩萨加维奇;K·普格利泽;张殷娜;杨翔元;M·C·R·巴西加鲁珀 申请(专利权)人: 伊鲁米纳公司;伊鲁米纳新加坡有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869
代理公司: 北京市金杜律师事务所 11256 代理人: 陈文平;韦嵥
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 带有 电荷 标签 核苷酸 及其 使用方法
【权利要求书】:

1.一种方法,其包括:

检测被标记的核苷酸通过聚合酶向与模板多核苷酸链互补的新生多核苷酸链中的掺入,其中所述聚合酶通过系链而被栓系到固体载体导电通道,

所述被标记的核苷酸是式I的化合物,

其中,n是3至10的整数,

m是1至10的整数,

t是0至50的整数,

X1是直接键、C1-C10烷基、C1-C10氧杂烷基、C1-C10硫杂烷基或C1-C10氮杂烷基,

X2是C1-C20烷基,其中任选一个或多个单独的CH2残基被肽键和(-O-CH2-CH2-)a中的一个或多个替代,其中a是1至24的整数,

X3是直接键或寡核苷酸,其中当所述标记靠近所述导电通道时,所述寡核苷酸与所述系链的受体区域杂交,

F1选自荧光团和直接键,且F2不存在或为荧光团,

A是或酰胺键,且

Y选自

q是1至100的整数,并且

B选自氨基酸、核苷酸、

其中各R选自Y、氢、和树状物;并且,其中当B是树状物时,q等于1,并且q数量个B具有电荷和电荷密度,并且

所述导电通道用于在掺入过程中检测被标记的核苷酸。

2.权利要求1的方法,其中电荷在约-100e与约+100e之间。

3.权利要求2的方法,其中电荷密度在每立方纳米约-100e与每立方纳米约+100e之间。

4.权利要求1的方法,其中电荷在约-200e至约+200e之间。

5.权利要求2的方法,其中电荷密度在每立方纳米约-200e和每立方纳米约+200e之间。

6.权利要求1的方法,其中q数量个B包括多核苷酸。

7.权利要求6的方法,其中多核苷酸选自分支多核苷酸、和一个或多个发夹环。

8.权利要求7的方法,其中多核苷酸包括两个至五个发夹环。

9.权利要求1的方法,其中q数量个B包括多肽。

10.权利要求9的方法,其中多肽选自分支多肽、卷曲多肽和卷曲螺旋多肽。

11.权利要求1的方法,其中B包括氨基酸,并且q数量个B中的一个或多个包括甲基赖氨酸、二甲基赖氨酸或三甲基赖氨酸。

12.权利要求1的方法,其中B是包括一个或多个结构重复单元和多个末端单元的z代的树状物,其中z是1至6的整数,结构末端单元选自:

其中

p1是1至3的整数,其中p1个-CH2-基团中的任一个或多个任选地被1至3个-O-CH2-CH2-基团替代,

p2是1至3的整数,其中p2个-CH2-中的任一个或多个任选地被1-3个-O-CH2-CH2-基团替代,并且

端基选自羧酸、磺酸、膦酸、精胺基、氨基和季铵基。

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