[发明专利]通过细菌性宏基因组分析来诊断中风的方法

权利要求书

1.一种为诊断中风提供信息的方法，该方法包括以下过程：

(a)从分离自受试者样品的细胞外囊泡中提取DNA；

(b)使用包含SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2的成对的引物对所提取的所述DNA进行PCR；以及

(c)通过对所述PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定来源于所述受试者的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

2.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：来源于选自由脱铁杆菌门(Deferribacteres)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、柔膜菌门(Tenericutes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、广古菌门(Euryarchaeota)、TM7门、浮霉菌门(Planctomycetes)、GN02门和OD1门组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

3.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：来源于选自由盐细菌纲(Halobacteria)、脱铁杆菌纲(Deferribacteres)、疣微菌纲(Verrucomicrobiae)、叶绿体纲(Chloroplast)、柔膜细菌纲(Mollicutes)、产芽胞菌纲(Erysipelotrichi)、甲烷杆菌纲(Methanobacteria)、黄小杆菌纲(Flavobacteriia)、浮霉菌纲(Planctomycetia)、TM7-1纲和ZB2纲组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

4.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：来源于选自由嗜盐杆菌目(Halobacteriales)、脱铁杆菌目(Deferribacterales)、木霉菌目(Streptophyta)、红环菌目(Rhodocyclales)、疣微菌目(Verrucomicrobiales)、立克次氏体目(Rickettsiales)、巴氏杆菌目(Pasteurellales)、产芽胞菌目(Erysipelotrichales)、甲烷杆菌目(Methanobacteriales)、军团菌目(Legionellales)和黄杆菌目(Flavobacteriales)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

5.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：来源于选自由皮生球菌科(Dermacoccaceae)、脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)、梭杆菌科(Fusobacteriaceae)、乳杆菌科(Lactobacillaceae)、红环菌科(Rhodocyclaceae)、疣微菌科(Verrucomicrobiaceae)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、类诺卡氏菌科(Nocardioidaceae)、丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)、巴氏杆菌科(Pasteurellaceae)、产芽胞菌科(Erysipelotrichaceae)、棒状杆菌科(Corynebacteriaceae)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、理研菌科(Rikenellaceae)、臭杆菌科(Odoribacteraceae)、微球菌科(Micrococcaceae)、微杆菌科(Microbacteriaceae)、产碱杆菌科(Alcaligenaceae)、甲烷杆菌科(Methanobacteriaceae)、黄杆菌科(Flavobacteriaceae)和克姆氏菌科(Cryomorphaceae)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。