[发明专利]通过细菌性宏基因组分析来诊断中风的方法

说明书

本发明涉及通过细菌性宏基因组分析来诊断中风的方法，并且更具体地，涉及通过对来源于受试者的样品进行细菌性宏基因组分析以分析来源于特定细菌的细胞外囊泡的含量的波动来诊断中风的方法。由环境中存在的细菌分泌的细胞外囊泡被吸收到体内并且会对炎症响应有直接影响。中风在在显示症状之前在其早期阶段难以诊断，因此难以有效治疗。根据本发明，通过使用来源于人的样品经由对来源于细菌的细胞外囊泡的宏基因组分析，可以预先预测中风的发病风险，使得可以诊断和预测中风风险组，从而通过适当管理延迟或预防疾病的发生。甚至在疾病发作后也可以进行早期诊断，从而减少中风的发生率并提高治疗效果。

技术领域

本发明涉及通过细菌性宏基因组分析来诊断中风的方法，并且更具体地，涉及通过使用来源于受试者的样品进行细菌性宏基因组分析以分析来源于特定细菌的细胞外囊泡的含量的增加或减少来诊断中风的方法。

背景技术

中风(卒中)是由异常血液流向大脑这种异常性引起的局部神经功能缺损症状的总称。中风是指症状的术语，并且在指医疗状况时，称为脑血管意外(CVA)。在美国，这被称为脑血管中风。就中医而言，它通常被称为麻痹，但这是更广泛的表达。中风大致分为脑梗塞和脑出血。

大脑仅占身体总重量的2％，但流向大脑的血液占心输出量的15％，耗氧量占身体总耗氧量的20％。另外，由于大脑仅使用葡萄糖作为能源，因此即使暂时中断能量供应也容易发生坏死。因此，脑血流异常与脑损伤密切相关。已知中风的各种危险因素是多种多样的，例如，包括年老、男性、中风的家族病史以及非洲和亚洲种族在内的恒定的危险因素是已知的，以及可变的危险因素，例如短暂性脑缺血发作、中风病史、高血压、冠状动脉狭窄、糖尿病、吸烟、心肌梗塞、心房颤动，充血性心力衰竭病史、左心衰竭、过量饮酒和凝血障碍是已知的。中风是具有高死亡率的疾病，需要大量的治疗费用和时间，并且即使治疗也容易留下障碍或疾病。此外，在许多情况下，中风会在治疗后复发。因此，最重要的是，预防中风很重要。

同时，众所周知，在人体内共生的微生物数量为100万亿，是人类细胞数的10倍，微生物的基因数超过人类基因数的100倍。微生物群(microbiota)是一种微生物群落，其包括在给定栖息地中存在的细菌、古细菌和真核生物。已知肠道微生物群在人类的生理现象中起着至关重要的作用，并通过与人类细胞的相互作用对人体健康和疾病产生重大影响。共生地生活在人体内的细菌分泌纳米级的囊泡，以便与其他细胞交换关于基因、蛋白质、低分子量化合物等的信息。粘膜形成不允许尺寸为200nm或以上的粒子通过的物理阻隔膜，因此共生在粘膜中的细菌不能通过，但来源于细菌的细胞外囊泡具有大约为100nm或以下的尺寸，因此相对自由地通过粘膜并被吸收到人体内。

宏基因组学(也称为环境基因组学)可以是针对从自环境中收集的样品获得的宏基因组数据的分析学。最近，使用基于16s核糖体RNA(16s rRNA)碱基序列的方法列出了人类微生物群的细菌组成，并且使用下一代测序(NGS)平台(Nature.2007Oct 18；449(7164):804-810)分析了16s rDNA碱基序列，其是16s核糖体RNA的基因。然而，关于中风的发生，尚无关于通过分析来源于细菌的囊泡中存在的宏基因组和诊断中风从人源性物质(例如血液)中鉴定中风的致病因子的方法的报道。

发明内容

[技术问题]

本发明人从作为来源于受试者的样品的血液中存在的来源于细菌的细胞外囊泡中提取了基因，并在这方面进行了宏基因组分析，以便提前诊断出中风的致病因子和风险，结果，鉴定出来源于细菌的细胞外囊泡可以作为中风的致病因子，从而基于此完成本发明。

因此，本发明的目的是提供一种通过来源于细菌的细胞外囊泡的宏基因组分析提供用于诊断中风的信息的方法。

然而，本公开的技术目标不限于上述目标，本领域普通技术人员根据下面的描述将清楚地了解其它未提及的技术目标。

[技术方案]