[发明专利]利用化学确定的重组核小体定量核小体修饰

权利要求书

1.一种用于定量生物样品中核小体修饰(组蛋白或DNA)丰度的方法，所述方法包括：

a.分离生物样品；

b.从所述生物样品制备天然单核小体和/或多核小体文库，其中，所述文库包括在靶表位中包含一个或多个核心组蛋白和/或DNA修饰的核小体；

c.制备包括核心组蛋白和/或DNA修饰靶表位的重组单核小体和/或多核小体样品；

d.提供不同浓度的所述重组核小体样品以产生参考标准品；

e.向所述天然核小体文库和重组核小体参考物中加入亲和试剂；

f.进行基于亲和试剂的测定以测量所述天然核小体文库和所述重组核小体参考标准品中核小体修饰的量；以及

g.通过比较所述天然核小体文库中的相对丰度与所述参考标准品中的相对丰度，定量所述靶表位中核小体修饰的丰度。

2.一种用于定量生物样品中单个核小体上两个或更多个修饰(组蛋白或DNA)的丰度的方法，所述方法包括：

a.分离生物样品；

b.从所述生物样品制备天然单核小体和/或多核小体文库，其中，所述文库包括在靶表位中包含两个或更多个核心组蛋白和/或DNA修饰的核小体；

c.制备包括携带所述两个或更多个组蛋白和/或DNA修饰靶表位的核小体的重组单核小体和/或多核小体样品；

d.提供不同浓度的所述重组核小体样品以产生参考标准品；

e.向所述天然核小体文库和重组核小体参考物中加入两种或更多种亲和试剂；

f.进行基于亲和试剂的测定以测量所述天然核小体文库和所述重组核小体参考标准品中核小体修饰的量；以及

g.通过比较所述天然核小体文库中的相对丰度与所述参考标准品中的相对丰度，定量所述靶表位中核小体修饰的丰度。

3.一种用于定量来自患有疾病或疾患的受试者的生物样品中一个或多个核小体修饰(组蛋白或DNA)的丰度的方法，所述方法包括：

a.从所述受试者中分离生物样品；

b.从所述生物样品制备天然单核小体和/或多核小体文库，其中，所述文库包括在靶表位(一个或多个)中包含一个或多个核心组蛋白和/或DNA修饰的核小体；

c.制备包括携带所述一个或多个组蛋白和/或DNA修饰靶表位的核小体的重组单核小体和/或多核小体样品；

d.提供不同浓度的所述重组核小体样品以产生参考标准品；

e.向所述天然核小体文库和重组核小体参考物中加入一种或多种亲和试剂；

f.进行基于亲和试剂的测定以测量所述天然核小体文库和所述重组核小体参考标准品中核小体修饰的量；以及

g.通过比较所述天然核小体文库中的相对丰度与所述参考标准品中的相对丰度，定量所述靶表位中核小体修饰的丰度。

4.一种基于对一个或多个核小体修饰的绝对定量来确定患有与表观遗传修饰相关的疾病或疾患的受试者的预后的方法，所述方法包括:

a.从所述受试者中分离生物样品；

b.从所述生物样品制备天然单核小体和/或多核小体文库，其中，所述文库包括在靶表位(一个或多个)中包含一个或多个核心组蛋白和/或DNA修饰的核小体；

c.制备包括携带所述一个或多个组蛋白和/或DNA修饰靶表位的核小体的重组单核小体和/或多核小体样品；

d.提供不同浓度的所述重组核小体样品以产生参考标准品；

e.向所述天然核小体文库和重组核小体参考物中加入一种或多种亲和试剂；

f.进行基于亲和试剂的测定以测量所述天然核小体文库和所述重组核小体参考标准品中核小体修饰的量；

g.通过比较所述天然核小体文库中的相对丰度与所述参考标准品中的相对丰度，定量所述靶表位中核小体修饰的丰度；以及

h.基于所述一个或多个靶表位的绝对丰度确定所述受试者的预后。