[发明专利]利用化学确定的重组核小体定量核小体修饰

说明书

本发明涉及携带组蛋白和/或DNA修饰的重组/半合成核小体作为用于定量来自生物样品的共价修饰(在组蛋白上或包裹DNA上)、变体或突变核小体(统称“修饰核小体”或“核小体修饰”)的参考标准品的用途。本发明还涉及使用该测定来准确定量作为疾病生物标志物的单个或组合核小体修饰的方法。

优先权声明

本申请要求提交于2018年3月1日的美国申请序列号62/637,066的优先权，其全部内容通过援引并入本文中。

技术领域

本发明涉及携带组蛋白和/或DNA修饰的重组/半合成核小体作为用于定量来自生物样品的共价修饰(在组蛋白上或包裹DNA上)、变体或突变核小体(统称“修饰核小体”或“核小体修饰”)的参考标准品的用途。本发明还涉及使用该测定来准确定量作为疾病生物标志物的单个或组合核小体修饰的方法。

背景技术

核小体是染色质的重复单位，由一体地包裹在组蛋白八聚体(每个核心组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)包含两个拷贝)周围的147个碱基对的DNA组成(Margueron et al.,Nat.Rev.Genet.11(4):285(2010)).染色质结构和功能的变化调节不同的细胞活性，包括基因表达、DNA修复、染色体传递和细胞分化(Brown et al.,Hum.Mol.Genet.21(R1):R90(2012)；Lahtz et al.,J.Mol.Cell.Biol.3(1):51(2011)；Lunyak et al.,Hum.Mol.Genet.17(R1):R28(2008)；Reik,Nature 447(7143):425(2007))。这些过程部分地由可逆的组蛋白翻译后修饰(PTM；例如赖氨酸甲基化或乙酰化)介导，其具有直接作用或被效应结合蛋白“读取”以转导特定的下游信号通路。迄今为止，已鉴定出100多种独特的组蛋白PTM，其中许多与人类疾病相关，从神经退行性变(Landgrave-Gomez et al.,Front.Cell.Neurosci.9:58(2015))和代谢综合征(DelCurto et al.,Curr.Opin.Clin.Nutr.Metab.Care 16(4):385(2013)；Wang et al.,Antioxid.RedoxSignal 17(2):282(2012))到癌症(Chopra et al.,Cancer Genet.208(5):192(2015)；Greenblatt et al.,Leukemia 28(7):1396(2014)；Gajer et al.,Oncogenesis 4:e137(2015)；

Witt et al.,Curr.Pharm.Des.15(4):436(2009)；Hanmod et al.,Pediatr.Blood Cancer 62(1):52(2015)；Kobayashi et al.,Oncogene 32(21):2640(2013))。值得注意的是，PTM相互作用蛋白(又称“阅读器”)是高度可药物作用的，这使得它们成为多种人类疾病/疾患的特殊治疗靶点(Arrowsmith et al.,Nat.Rev.DrugDiscov.11(5):384(2012))。此外，组蛋白PTM是一种新兴的癌症生物标志物，其可用于早期疾病检测和预后，以及告知个性化治疗策略(Khan et al.,World J.Biol.Chem.6(4):333(2015)；Chervona et al.,Am.J.Cancer Res.2(5):589(2012))。