[发明专利]用于鉴定稳健型败血症亚型的分类器

权利要求书

1.一种用于确定患有败血症的受试者是否具有炎性表型、适应性表型或凝血性表型的方法，所述方法包括：

(a)测量从所述受试者获得的RNA的样品中的由以下中的至少两种来编码的RNA转录物的数量：ARG1、LCN2、LTF、OLFM4、HLA-DMB、YKT6、PDE4B、TWISTNB、BTN2A2、ZBTB33、PSMB9、CAMK4、TMEM19、SLC12A7、TP53BP1、PLEKHO1、SLC25A22、FRS2、GADD45A、CD24、S100A12、STX1A、KCNMB4、CRISP2、HTRA1、PPL、RHBDF2、ZCCHC4、YKT6、DDX6、SENP5、RAPGEF1、DTX2和RELB，以获得基因表达数据；以及

(b)基于所述基因表达数据，提供指示所述受试者是否具有炎性表型、适应性表型或凝血性表型的报告，其中：

(i)增加的ARG1、LCN2、LTF和/或OLFM4和/或降低的HLA-DMB指示所述受试者具有炎性表型；

(ii)增加的YKT6、PDE4B、TWISTNB、BTN2A2、ZBTB33、PSMB9、CAMK4、TMEM19、SLC12A7、TP53BP1、PLEKHO1、SLC25A22和/或FRS2和/或降低的GADD45A、CD24、S100A12和/或STX1A指示所述受试者具有适应性表型；并且

(iii)增加的KCNMB4、CRISP2、HTRA1和/或PPL和/或降低的RHBDF2、ZCCHC4、YKT6、DDX6、SENP5、RAPGEF1、DTX2和/或RELB指示所述受试者具有凝血性表型。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述测量步骤通过测序来完成。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述测量步骤通过RT-PCR来完成。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述测量步骤通过标记RNA或由其制备的cDNA并将经过标记的RNA或cDNA与支持物，例如阵列或珠粒，杂交来完成。

5.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述样品包括从全血、白细胞、嗜中性粒细胞或血沉棕黄层中分离出的RNA。

6.一种用于治疗患有败血症的受试者的方法，所述方法包括：

(a)接收指示所述受试者是否具有炎性表型、适应性表型或凝血性表型的报告，其中所述报告基于通过以下方法获得的基因表达数据：测量从所述受试者获得的RNA的样品中的由以下中的至少两种编码的RNA转录物的数量：ARG1、LCN2、LTF、OLFM4、HLA-DMB、YKT6、PDE4B、TWISTNB、BTN2A2、ZBTB33、PSMB9、CAMK4、TMEM19、SLC12A7、TP53BP1、PLEKHO1、SLC25A22、FRS2、GADD45A、CD24、S100A12、STX1A、KCNMB4、CRISP2、HTRA1、PPL、RHBDF2、ZCCHC4、YKT6、DDX6、SENP5、RAPGEF1、DTX2和RELB，其中：

(i)增加的ARG1、LCN2、LTF和/或OLFM4和/或降低的HLA-DMB指示所述受试者具有炎性表型；

(ii)增加的YKT6、PDE4B、TWISTNB、BTN2A2、ZBTB33、PSMB9、CAMK4、TMEM19、SLC12A7、TP53BP1、PLEKHO1、SLC25A22和/或FRS2和/或降低的GADD45A、CD24、S100A12和/或STX1A指示所述受试者具有适应性表型；并且

(iii)增加的KCNMB4、CRISP2、HTRA1和/或PPL和/或降低的RHBDF2、ZCCHC4、YKT6、DDX6、SENP5、RAPGEF1、DTX2和/或RELB指示所述受试者具有凝血性表型；以及

(b)基于所述受试者是否被指示为具有炎性表型、适应性表型或凝血性表型来治疗所述受试者。